探寻条斑紫菜(Pyropia yezoensis)变色奥秘:为紫菜养殖产业筑牢防线
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时间:2025年05月10日
来源:Marine Biotechnology 2.6
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条斑紫菜(Pyropia yezoensis)养殖在东亚水产养殖业意义重大,然而营养缺乏引发的 “变色” 问题严重影响产量与质量。研究人员开展转录组分析(RNA-Seq),发现富营养和贫营养下相关通路及基因变化,还验证 7 个潜在变色标记基因,助力解决变色难题。
条斑紫菜(Pyropia)养殖是东亚地区极为重要的水产养殖产业。营养缺乏引发的 “变色” 现象,对该产业构成严重威胁,极大地影响了收获品质和产量。在这项研究中,研究人员对条斑紫菜(P. yezoensis)进行转录组分析(RNA-Seq),旨在深入探究因营养限制导致变色的生理响应背后的分子机制。京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析显示,在营养丰富的条件下,参与光合作用(碳固定)和呼吸作用(三羧酸循环(TCA cycle)和糖酵解)的通路更为活跃。相反,在营养缺乏的条件下,观察到与摄取外部物质和应激反应相关的基因上调。此外,通过逆转录定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)分析,成功验证了从 RNA-Seq 结果中鉴定出的 7 个基因(ant1-2、pup、drg2、ankrd、bckdha、lhcb和一个未知基因)作为潜在的变色标记基因。该研究为条斑紫菜(P. yezoensis)变色现象提供了基础的分子层面见解,有助于未来开发变色预测方法以及培育抗变色的条斑紫菜(Pyropia)品种。
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