铜绿假单胞菌谷氨酰 - tRNA 合成酶(PaGluRS)架构揭示二聚体 Ib 类氨酰 - tRNA 合成酶(AaRSs)亚家族奥秘,开拓抗菌新靶点
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时间:2025年05月10日
来源:Proceedings of the National Academy of Sciences 9.4
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铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)耐药性问题严峻,威胁健康。研究人员针对其谷氨酰 - tRNA 合成酶(PaGluRS)开展研究,发现它是旋转假对称同二聚体,有独特架构。这为预测 α2型 Ib 类 AaRS 家族成员提供依据,有望成为新分子靶点。
氨酰 - tRNA 合成酶(AaRSs)是一个古老的酶家族,结构多样,分为两大类。大多数 AaRSs 的功能与它们的寡聚状态紧密相连。以往谷氨酰 - tRNA 合成酶(GluRSs)被归类为单体,但目前研究发现,在铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)中表达的形式是旋转假对称的同二聚体,具有亚基间 tRNA 结合位点。两个亚基都呈现高度弯曲的 “管带” 构象,反密码子结合结构域朝向活性位点。tRNA 结合位点的形状与单体 GluRSs 的相似,但它是通过反密码子结合结构域大约 180 度的旋转以及反密码子和 D 臂结合结构域的二聚化形成的。因此,每个反密码子结合结构域都能识别结合在相邻原体上的 tRNA 的反密码子环。此外,反密码子结合结构域有一个 α - 螺旋的 C 末端延伸,包含一个保守的富含赖氨酸的共有基序,位于预测的受体臂位置附近,这表明其在 tRNA 识别中具有双重功能。PaGluRS 独特的架构拓宽了 GluRS 家族的结构多样性,并且现在已经确定了所有细菌 AaRS 亚类的成员合成酶都存在寡聚化现象。
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