菲律宾非洲猪瘟病毒(ASFV)的基因组分型与分子特征解析

来自菲律宾的研究人员针对该国90%省份爆发的非洲猪瘟(ASF)疫情，采用无扩增全基因组测序技术，对2020年农场疫情中心的ASFV毒株进行系统发育分析。研究成功组装80-99%基因组序列，鉴定出基因2型毒株及其亚型特征，并发现相对于参考株的潜在变异位点，为东南亚ASFV防控提供了关键分子流行病学数据。

　　

非洲猪瘟(African swine fever, ASF)作为一种席卷家猪和野猪的病毒性大流行，已在亚洲、欧洲及加勒比地区引发大规模疫情。菲律宾境内90%省份遭受波及，然而当前流行毒株的遗传特征仍缺乏系统研究。2020年，科研团队从该国暴发核心区域的养殖场血液样本中，成功获取两株ASFV的全基因组数据。通过创新的无扩增全基因组测序(whole-genome sequencing)技术和定制化生物信息流程，实现了80-99%基因组完整拼接。

分析显示：这些毒株属于全球主要流行的基因2型(genotype 2)，基于关键遗传标记进一步明确了其亚型特征。与现有参考毒株相比，研究还鉴定出多个潜在变异位点。该成果首次系统揭示了2019年菲律宾ASF疫情暴发以来，当地流行毒株的基因组进化特征，为建立区域性ASFV分子监测网络奠定了重要基础。