肠道微生物群代谢途径与软骨肉瘤发生的因果关联:孟德尔随机化分析揭示关键机制

【字体: 时间:2025年05月11日 来源:BMC Cancer 3.4

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  软骨肉瘤(chondrosarcoma)的发病机制尚未完全明确,为探究肠道微生物群代谢途径(GMMP)与软骨肉瘤相关基因 1(CSAG1)的因果关系,研究人员运用双向和多变量孟德尔随机化(MR)分析,发现部分 GMMP 对 CSAG1 有显著因果效应,为揭示软骨肉瘤发病机制提供新视角。

  在人体这个奇妙的 “小宇宙” 里,隐藏着无数关乎健康与疾病的奥秘。其中,恶性骨肿瘤就像一群神秘又危险的 “闯入者”。近年来,它们的发病率悄然上升,而软骨肉瘤作为第二常见的原发性骨肉瘤,更是让人头疼不已。它在成年人中较为高发,且多数对化疗和放疗具有抗性,转移性或不可切除的软骨肉瘤患者治疗选择非常有限。更为关键的是,其具体发病机制至今仍是一团迷雾。
CSAG1 基因,如同软骨肉瘤研究中的一把 “神秘钥匙”,它在软骨肉瘤中高表达,与肿瘤的发生发展密切相关。而肠道微生物群,一直以来被视为人体健康的 “隐形守护者”,它在多种癌症的发生发展过程中扮演着重要角色。可在软骨肉瘤领域,肠道微生物群代谢途径(GMMP)与 CSAG1 之间的关系却鲜为人知。为了揭开这层神秘的面纱,来自长治市人民医院(长治医学院第三临床医院)和长治市和平医院(长治医学院第一临床医院)的研究人员展开了深入探究,相关研究成果发表在《BMC Cancer》上。

研究人员运用了多种技术方法来开展这项研究。首先,从公开数据库(OpenGWAS 和 GWAS Catalog)获取所需数据,包括 205 种 GMMP 数据和 CSAG1 数据 。接着,按照严格标准筛选工具变量(IVs),如要求单核苷酸多态性(SNPs)在 GWAS 数据中 P<5×10?? ,消除连锁不平衡(LD,r2<0.001 ,kb>10,000)等。之后,采用两样本双向 MR 分析和多变量 MR 分析来探究 GMMP 与 CSAG1 之间的因果关系,并运用多种方法进行敏感性分析,确保研究结果的可靠性。

下面来看具体的研究结果:

  • GMMP 与 CSAG1 的因果关系分析:研究人员挑选了 205 个与 GMMP 相关的 SNPs 进行初步因果分析。通过多种 MR 分析方法,如逆方差加权法(IVW)等,发现从谷氨酸合成四吡咯(tetrapyrrole biosynthesis from glutamate)、甲基萘醌 6 合成(menaquinol 6 biosynthesis)、糖原降解 II(glycogen degradation II)、8 - 氨基 - 7 - 氧代壬酸合成(8-amino-7-oxononanoate biosynthesis)、紫杉二烯合成(taxadiene biosynthesis)、糖酵解(glycolysis)和 tRNA 充电(tRNA charging)这 7 种 GMMP 与 CSAG1 的高表达存在显著因果关系。
  • 敏感性分析:利用 Cochrane's Q 检验检测 IVW 模型结果的异质性,发现 GMMP 丰度在 IVW 模型中 P>0.05,说明不存在显著异质性;通过 MR-Egger 回归评估 IVs 的多效性,结果显示 7 种 GMMP 的工具效应和对 CSAG1 的因果效应推断不受横向多效性影响;留一法分析表明每组 IVs 的总效应没有明显变化,进一步证明了研究结果的稳健性。
  • CSAG1 对 GMMP 的影响评估:研究人员进行反向因果分析,结果显示 CSAG1 与 GMMP 之间不存在显著因果关系,即 CSAG1 的表达不会引起 GMMP 的变化。
  • GMMP 对 CSAG1 影响的多变量 MR 分析:为评估显著的 GMMP 对 CSAG1 的直接影响,研究人员进行多变量 MR 分析,在校正生物性别和衰老等因素后,发现四吡咯合成、甲基萘醌 6 合成、糖原降解 II、糖酵解和 tRNA 充电仍然对 CSAG1 有显著因果效应。

在讨论部分,研究人员指出,这是首次通过双向两样本 MR 分析探究 GMMP 与 CSAG1 之间的因果关系。虽然未发现两者的反向因果关系,但明确了 GMMP 与 CSAG1 之间存在强正向因果关系。研究还发现多种 GMMP 在软骨肉瘤发展中起到重要作用,例如四吡咯合成参与了细胞的多种生理过程,其在软骨肉瘤发展中的作用值得深入研究;甲基萘醌 6 合成在其他疾病中也有相关研究报道,此次发现其与软骨肉瘤的关联,为进一步研究提供方向;糖原降解途径的基因丰度在不同疾病状态下有所不同,本研究证实它可直接影响 CSAG1 表达从而调控软骨肉瘤发展;8 - 氨基 - 7 - 氧代壬酸合成途径在疾病发展中可能起保护作用;紫杉二烯合成影响 CSAG1 表达,但其具体机制有待探索;糖酵解在多种疾病中与正常状态存在差异,在软骨肉瘤研究中也发现其肠道菌群糖酵解途径的富集;tRNA 充电途径通过 CSAG1 在软骨肉瘤进展中发挥重要作用 。

这项研究意义重大,它为深入了解肠道微生物群介导的软骨肉瘤发展机制提供了新的视角,识别出的潜在因果途径为未来软骨肉瘤的研究和治疗开辟了新方向。不过,研究也存在一些局限性,如无法完全排除其他混杂因素导致的弱 IV 偏差,数据来自欧洲人群,可能无法推广到其他人群,未涉及基因表达和变异对临床结果的影响,GMMP 与软骨肉瘤关联的潜在机制也有待进一步探索。但总体而言,该研究为后续结合体外和体内实验进一步验证研究结果、阐明潜在机制奠定了坚实基础,有望推动软骨肉瘤治疗领域的新突破。

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