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Leber 遗传性视神经病变(LHON)发病机制不明,为探究其影响因素,研究人员分析 51 例携带常见线粒体变体患者的基因组数据。结果发现代谢通路相关核变体与 LHON 外显率增加有关,为疾病研究和治疗提供新方向。
在神秘的人体微观世界里,有一种疾病悄然威胁着人们的视力,它就是 Leber 遗传性视神经病变(LHON)。这是一种常见的线粒体疾病,每 27000 - 31000 人中就可能有一人患病。患者会出现急性或亚急性双侧无痛性视力丧失,常常在二三十岁时发病,还伴有色觉异常和中心或中心盲点等症状。
尽管 LHON 备受关注,但它的发病机制却如同迷雾一般难以捉摸。大多数 LHON 病例与线粒体 DNA(mtDNA)的变异有关,其中约 90 - 95% 的患者携带三种主要的线粒体变体,即 m.11778G>A(p.Arg340His)、m.14484T>C(p.Met64Val)和 m.3460G>A(p.Ala52Thr) 。这些变体破坏了线粒体呼吸链复合物 I(CI)的结构,导致 ATP 合成减少,活性氧(ROS)生成增加,而视网膜神经节细胞(RGCs)对能量需求高,ROS 的积累使它们特别容易受到 ATP 水平下降的影响,最终导致细胞死亡和轴突变性。
然而,问题接踵而至。为什么携带相同线粒体变体的人,有的会发病,有的却安然无恙?而且,男性患者明显多于女性,这背后又隐藏着什么秘密?此前,虽然有研究探索过多种可能的影响因素,如烟草和酒精消费、激素差异、维生素缺乏以及遗传修饰因素等,但都没有给出令人信服的解释。
为了揭开这些谜团,来自英国帝国理工学院医学院、剑桥大学临床神经科学系以及西班牙国家基因组分析中心(Centro Nacional de Análisis Genómico,CNAG)的研究人员踏上了探索之旅。他们开展了一项系统性研究,旨在寻找潜在的核变异和通路,解开引发 LHON 的关键因素。
这项研究成果发表在《European Journal of Human Genetics》上,具有重要意义。它不仅加深了人们对 LHON 病理生理学的理解,还为识别新的疾病修饰靶点提供了新的框架,有望为未来的治疗和遗传咨询开辟新道路。
研究人员为开展此项研究,主要运用了以下关键技术方法:首先,利用 RD - Connect 基因组 - 表型分析平台(GPAP),筛选出 51 名携带三种常见 LHON 致病性线粒体变体之一的参与者,并由专家临床医生对其进行 “患病” 或 “未患病” 状态的分类;然后,通过该平台及相关文献确定研究的核基因,应用标准过滤标准识别罕见变体,并依据相关指南判定变体的致病性;最后,运用 R 语言进行计算分析和统计检验,借助相关数据库进行基因功能注释和通路分析。
下面来看看具体的研究结果:
- 队列特征:研究共纳入 51 人,其中 23 人表现出 LHON 表型(患病队列),28 人未出现相关症状(未患病队列)。未患病队列中部分人无疾病表型,部分人患有其他疾病。两个队列均以男性为主,且携带不同线粒体变体的人数在两个队列中有差异 。
- 罕见变体分析:在患病和未患病队列中均鉴定出与线粒体功能相关的罕见核变体,但两个队列中变体的功能分布无显著差异,影响 CI 相关基因的变体负担也无差异。
- 基于患病样本率的预选基因分析:计算每个基因的患病样本率,对差异较大的基因进行通路分析,发现 “辅因子和维生素代谢” 通路具有统计学意义,涉及 DHTKD1 和 DLAT 基因,这与之前其他研究结果一致。
- 致病性变体分析:依据相关指南手动筛选出致病性变体,发现患病队列中参与代谢功能的变体比例较高,虽未达统计学显著差异,但进行更精细的通路分析后发现,患病队列中多个代谢通路具有统计学意义,如柠檬酸循环(TCA 循环)、丙酮酸代谢、脂肪酸降解等,涉及 DLAT、MDH2、ACADSB 和 ACADM 等基因。同时,在患病队列中发现与 CI 功能相关的致病性变体,而未患病队列中相关致病性变体涉及其他呼吸链复合物,这与之前关于 CI 相关致病修饰因子增强外显率的假设相符,但因样本量小无法得出明确结论。
在研究结论和讨论部分,研究人员发现代谢通路功能障碍与 LHON 表型增强存在关联。患病队列中多个基因参与乙酰辅酶 A 的生成和代谢,这些过程与 TCA 循环和电子传递链密切相关,任何对这些通路的额外损害都可能加剧 LHON 的表型。未患病队列中携带某些基因致病性变体的个体,未来可能有更高的发病风险。
然而,这项研究也存在一些局限性。比如,部分患者的发病时间不确定,数据中缺少重要的人口统计学信息,样本量较小,未对特定变体的修饰因子进行分析,且只研究了罕见变体的作用。尽管如此,该研究依然为后续更大规模的研究奠定了基础,未来有望通过更多研究进一步验证和拓展这些发现,深入了解 LHON 的发病机制,开发出更有效的治疗方法。