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为解决小细胞外囊泡(sEVs)分离方法的难题,研究人员开展 sEVs 分离新方法的研究。通过对比多种方法,发现 PEG 沉淀结合超滤(CPF)法能高效分离高纯度、高产量 sEVs,且适用于多组学分析,推动了 sEVs 在科研和临床的应用。
在生命科学和医学研究领域,小细胞外囊泡(small extracellular vesicles,sEVs)犹如一颗新星,备受关注。sEVs 是细胞释放的一类纳米级囊泡,直径在 30 - 200 纳米之间,它能携带蛋白质、核酸等生物分子,在细胞间通讯中发挥着关键作用,就像细胞之间传递信息的 “小信使”。由于 sEVs 可反映细胞的病理生理状态,在疾病诊断、治疗和药物递送等方面展现出巨大的潜力,因此成为了科研人员竞相探索的热门领域。
然而,sEVs 的研究之路并非一帆风顺。目前,科研人员在研究 sEVs 时面临着诸多挑战,其中最棘手的问题之一便是缺乏简单且经济高效的 sEVs 分离方法。常用的分离方法,如超速离心法(ultra - centrifugation,UC)、尺寸排阻色谱法(size - exclusion chromatography,SEC)和免疫亲和捕获法等,都存在各自的局限性。超速离心法虽能分离出 sEVs,但耗时久,还需要专门的设备和专业技术人员操作;尺寸排阻色谱法在分离复杂生物流体中的 sEVs 时效果欠佳;免疫亲和捕获法虽特异性强,但成本高昂。此外,对分离得到的 sEVs 进行准确表征也困难重重,现有的表征方法在临床应用中难以全面实施。正因如此,开发一种能满足研究和临床需求,可获得高纯度、高产量 sEVs 的简便方法迫在眉睫。
为了攻克这些难题,来自印度全印医学科学研究所(All India Institute of Medical Sciences)等多个机构的研究人员联合开展了一项极具意义的研究。他们致力于探索一种创新的 sEVs 分离方法,并将其与传统方法进行对比,旨在找到更优的解决方案。经过一系列严谨的实验和深入的分析,研究人员发现,采用聚乙二醇(PEG)沉淀结合超滤(CPF)的鸡尾酒策略效果显著。这种方法不仅操作相对简便,对实验室条件要求较低,而且分离得到的 sEVs 纯度高、产量也令人满意。更为重要的是,CPF 法与多组学分析兼容,这为 sEVs 在基础研究和临床诊断等领域的广泛应用奠定了坚实的基础。该研究成果发表在《Scientific Reports》上,为 sEVs 研究领域注入了新的活力。
在这项研究中,研究人员运用了多种关键技术方法。首先,在样本处理上,从健康个体采集唾液、外周血,培养 SH - SY5Y 神经母细胞瘤细胞获取细胞培养基,为后续实验提供样本来源。然后,采用 PEG 沉淀、PEG 沉淀结合超滤、超速离心和尺寸排阻色谱柱这四种方法分离 sEVs。在 sEVs 的表征方面,利用透射电子显微镜(TEM)观察其超微结构形态,纳米颗粒跟踪分析(NTA)测定浓度和粒径分布,蛋白质定量(BCA)法和免疫印迹法检测 sEVs 蛋白标记物表达情况。最后,对血浆来源的 sEVs 进行质谱分析、小 RNA 测序和脂质组学分析,评估 CPF 法在下游多组学研究中的适用性。
下面让我们详细了解一下研究结果。
- sEVs 的超微结构形态:通过透射电子显微镜观察发现,从细胞培养基、血浆和唾液中分离出的 sEVs 呈圆形囊泡结构,直径在 30 - 150 纳米之间,部分 sEVs 含有内部囊泡,且都具有脂质双分子层膜。对比不同方法,CPF 法分离得到的 sEVs 纯度最高,几乎没有非囊泡颗粒或杂质。此外,激光共聚焦显微镜实验显示,CPF 法分离的 sEVs 中 CD9(一种 sEVs 表面标记物)表达特异性更强,进一步证明了其纯度优势。
- sEVs 的定量分析:利用纳米颗粒跟踪分析(NTA)对 sEVs 进行浓度和粒径分布测定。结果表明,CP 法分离得到的 sEVs 浓度最高,而 UC 法最低,CPF 法和 SEC 法的浓度介于两者之间。在粒径方面,不同样本中,UC 和 SEC 法分离出的 sEVs 粒径较大,CP 法分离出的最小,且 SEC 法分离得到的 sEVs 粒径分布变化最大。研究人员还计算了颗粒与蛋白质的比率,发现 UC 和 SEC 法的比率较高,CPF 法次之,CP 法最低,这意味着从该比率评估纯度时,UC 和 SEC 法纯度较高,CPF 法也有不错的表现。
- sEVs 蛋白标记物的表达:免疫印迹分析显示,从唾液、血浆和细胞培养基中分离出的 sEVs 均表达预期的 sEVs 相关蛋白,如 CD63、CD9、Flotillin - 1 和 TSG101 等。在唾液和血浆来源的 sEVs 中,CPF 法分离得到的 sEVs 中 CD63 蛋白表达量最高,表明其 sEVs 产量最高,CP 法次之。在细胞培养基来源的 sEVs 中,CP 和 CPF 法分离得到的 sEVs 中 CD9 表达较高,TSG101 蛋白表达在各方法间无明显差异。此外,SEC 法分离的 sEVs 中,CD9 表达在不同分馏物中呈现特定变化趋势,且 CPF 法相较于 CP 法,Apolipoprotein B(ApoB)表达降低,说明 CPF 法能减少血浆蛋白污染,进一步证明其分离 sEVs 的优势。
- 血浆来源 sEVs 的多组学评估:对血浆来源的 sEVs 进行多组学分析,以评估 CPF 法的适用性。质谱分析中,总离子色谱图显示肽峰分离良好,表明 CPF 法与质谱分析兼容,样本质量高。在小 RNA 测序分析中,选择 miR - 16 - 5p 作为检测指标,熔解曲线分析显示其引物特异性好,且原始 Cq 值表明从血浆来源 sEVs 中分离的 RNA 质量较高。脂质组学分析中,总离子色谱图与已有研究相符,证明 CPF 法可用于全面分析 sEVs 脂质含量。
综合研究结果和讨论部分,这项研究具有重要意义。研究人员提出的 PEG 沉淀结合超滤(CPF)的鸡尾酒策略,为 sEVs 的分离提供了一种高效、简便且经济的方法。该方法在分离高纯度、高产量 sEVs 方面表现出色,且能很好地适用于下游多组学分析,极大地推动了 sEVs 在基础研究和临床诊断中的应用。这不仅有助于科研人员更深入地了解 sEVs 的生物学特性和功能,还为开发基于 sEVs 的新型诊断和治疗方法提供了有力支持,有望在未来的医学领域发挥重要作用,为人类健康事业做出贡献。