多组学数据与机器学习联用:揭秘 1 型糖尿病(T1DM)抗氧化生物标志物

【字体: 时间:2025年05月12日 来源:Free Radical Biology and Medicine 7.1

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  1 型糖尿病(T1DM)治疗面临困境,且缺乏有效早期诊断和病情监测的生物标志物。研究人员整合多组学数据与机器学习,筛选出如 GPX3 等关键蛋白。结果显示 GPX3 诊断价值高,还能缓解 β 细胞氧化损伤,为 T1DM 诊疗带来新方向。

  在医学领域,1 型糖尿病(T1DM)一直是个令人头疼的难题。它是一种慢性代谢疾病,主要是因为胰腺 β 细胞被自身免疫系统破坏了。这就好比胰腺里负责调节血糖的 “小工厂” 罢工了,导致胰岛素分泌不足,血糖代谢也就乱了套。目前,T1DM 患者只能依靠终身注射胰岛素来维持血糖稳定,但即便如此,还是无法避免血糖控制不佳带来的各种并发症,像视网膜病变、肾病、神经病变等,严重影响患者的生活质量。
更让人着急的是,现在缺乏有效的方法在疾病早期就发现它,也很难精准监测病情发展。氧化应激在 T1DM 的发病过程中起着关键作用,它就像一个捣乱分子,让体内的自由基和抗氧化防御失衡,产生大量活性氧(ROS)。这些 ROS 会到处搞破坏,损伤细胞里的脂质、蛋白质和核酸,直接让胰腺 β 细胞功能失调甚至凋亡,还会激活炎症反应,加速 T1DM 的到来。所以,要是能找到和 T1DM 相关的抗氧化生物标志物,那对于早期诊断和治疗这种疾病意义重大。

为了解决这些问题,南昌大学第二附属医院的研究人员展开了深入研究。他们整合了多组学数据和机器学习技术,试图找到能用于 T1DM 诊断和病情监测的血清抗氧化生物标志物。研究结果发现,GPX3 等五个关键蛋白和 T1DM 关系密切,其中 GPX3 的诊断价值最高,它和糖化血红蛋白(HbA1c)、空腹血糖等临床指标都有明显关联。而且,过表达 GPX3 还能保护胰腺 β 细胞免受 H2O2诱导的氧化损伤,缓解 T1DM 小鼠的症状和病理变化。这一研究成果发表在《Free Radical Biology and Medicine》上,为 T1DM 的诊疗开辟了新道路。

在研究过程中,研究人员主要运用了以下几种关键技术方法:首先,他们构建了 T1DM 小鼠模型,通过给小鼠腹腔注射链脲佐菌素(STZ)来诱导发病。接着,利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)对小鼠血清样本和人类转录组数据进行分析。同时,运用蛋白质组学技术,通过 LC-MS/MS 对 25 例 T1DM 患者和 25 例健康对照的血清样本进行分析,找出差异表达的蛋白质。最后,借助随机森林(RF)和支持向量机递归特征消除(SVM - RFE)等机器学习算法筛选关键蛋白。

研究结果具体如下:

  • 动物模型构建与疾病特征:选用 8 - 12 周龄的健康雄性 C57BL/6 小鼠,在特定环境下饲养适应后,给小鼠禁食 18 小时,然后腹腔注射不同剂量的 STZ(40mg/kg 和 80mg/kg),成功构建出不同严重程度的 T1DM 小鼠模型。这些小鼠的血糖水平、HbA1c、胰岛素水平和体重变化都符合 T1DM 的特征。
  • 差异蛋白筛选:对 25 例 T1DM 患者和 25 例健康对照的血清样本进行蛋白质组学分析(LC-MS/MS),发现有 33 种差异表达的蛋白质,这些蛋白主要富集在氧化应激相关通路。
  • 关键蛋白确定:通过随机森林(RF)和支持向量机递归特征消除(SVM - RFE)等机器学习算法,从众多蛋白中筛选出了五个关键蛋白,分别是 GPX3、GSTP1、PRDX6、SOD1 和 MSRB2。其中,GPX3 的诊断价值最为突出。
  • 功能验证:进一步研究发现,过表达 GPX3 可以保护胰腺 β 细胞免受 H2O2诱导的氧化损伤,在 T1DM 小鼠模型中,还能缓解疾病症状和病理变化。

研究结论和讨论部分指出,T1DM 作为一种典型的自身免疫性疾病,虽然现有治疗手段能一定程度上控制病情,但患者仍面临诸多风险。本研究成功找到了和 T1DM 病情发展密切相关的抗氧化应激蛋白,尤其是 GPX3,它不仅有望成为 T1DM 诊断和病情监测的生物标志物,还能通过调节氧化应激保护胰腺 β 细胞。这一成果加深了人们对 T1DM 病理生理机制的理解,为开发新的治疗策略提供了理论依据,未来或许能让 T1DM 患者得到更精准、有效的治疗,大大改善他们的生活质量和治疗效果。

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