新型黄芩素衍生物:抗击新冠病毒的潜在 “利刃”——SARS-CoV-2 Mpro共价抑制剂的深度探究

【字体: 时间:2025年05月12日 来源:Bioorganic Chemistry 4.5

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  新冠疫情严峻,SARS-CoV-2 主要蛋白酶(Mpro)成为抗病毒治疗关键靶点。研究人员探究黄酮类化合物作为 Mpro抑制剂的构效关系(SARs),发现新型溴代黄芩素衍生物 BA-21 抑制效果显著,为抗新冠药物研发提供新方向。

  新冠疫情的爆发,给全球带来了巨大的挑战,严重影响了人们的生活、经济的发展和公共健康。在这场与病毒的战斗中,寻找有效的治疗药物成为当务之急。SARS-CoV-2 主要蛋白酶(Mpro)在病毒复制过程中扮演着至关重要的角色,它负责处理病毒的多聚蛋白,是病毒繁衍不可或缺的一环。因此,将 Mpro作为靶点开发抗病毒药物,成为了极具前景的研究方向。
此前的研究发现,虽然有不少化合物对 Mpro有抑制作用,但仍存在诸多问题。例如,大多数天然黄酮类化合物的抗 Mpro活性较弱,而且它们的共价结合位点、失活动力学以及抑制机制都尚未完全明确。为了解开这些谜团,推动抗新冠药物的研发,来自国内的研究人员开展了一项深入的研究。

研究人员的努力取得了重要成果。他们发现了新型合成黄酮类化合物对 Mpro具有强大的抑制活性,还明确了黄酮类化合物 A 或 B 环上的儿茶酚或连苯三酚部分对抗 Mpro活性起着关键作用,而这些部分的 O - 糖基化或 O - 甲基化修饰会导致抗 Mpro活性丧失。这一研究成果发表在《Bioorganic Chemistry》上,为抗 SARS-CoV-2 药物的开发提供了新的思路和方向,在抗击新冠疫情的道路上迈出了重要一步。

研究人员主要运用了以下几种关键技术方法:首先是基于荧光共振能量转移(FRET)的生化测定法,以此来评估天然黄酮类化合物的抗 Mpro潜力;接着使用 Mpro失活动力学测定,探究化合物对 Mpro的抑制特性;还通过质谱法的化学蛋白质组学分析,确定化合物与 Mpro的共价结合位点;此外,运用共价对接和分子动力学模拟,从分子层面深入了解抑制机制。

测试天然黄酮类化合物的抗 Mpro潜力


研究人员采用 FRET 生化测定法,对 109 种天然黄酮类化合物的抗 Mpro潜力展开研究。结果发现,黄芩素、去甲汉黄芩素、红景天苷等多种黄酮类化合物表现出较强的抗 Mpro效果。经过 60 分钟的预孵育,这些化合物能将 Mpro的活性降低至对照组水平的 50% 以下。后续进行的时间依赖性抑制试验,进一步深入探究了它们的抑制特性。

结构 - 活性关系(SARs)分析


在研究过程中,研究人员对黄酮类化合物的结构进行了详细剖析。他们发现,黄酮类化合物 A 或 B 环上的儿茶酚或连苯三酚部分对抗 Mpro活性至关重要。当这些部分进行 O - 糖基化或 O - 甲基化修饰时,化合物的抗 Mpro活性会显著降低甚至丧失。这一发现揭示了黄酮类化合物结构与抗 Mpro活性之间的紧密联系,为后续的药物设计提供了重要的理论依据。

黄芩素衍生物的设计与合成


为了进一步提高抗 Mpro的效果,研究人员以黄芩素为基础,设计并合成了 55 种黄芩素衍生物。在设计过程中,他们特意保留了黄芩素关键的连苯三酚部分,目的是促进其与 Mpro中半胱氨酸残基的巯基形成稳定的共价键。在众多衍生物中,C-8 溴取代的黄芩素(BA-21)脱颖而出,展现出最为强大的抗 Mpro效果,其 IC50值达到 0.35 μM,相比母体化合物黄芩素,抑制效果提升了 10 倍。

BA-21 的抑制机制研究


研究人员运用多种技术手段,对 BA-21 的抑制机制展开深入研究。失活动力学测定表明,BA-21 是一种高效的 Mpro灭活剂,其灭活效率高达 555.56 M-1 s-1 ,约为黄芩素(76.50 M-1 s-1 )的 7.26 倍。化学蛋白质组学和分子对接模拟显示,黄芩素能够共价修饰 Mpro的四个半胱氨酸残基,而 BA-21 则更胜一筹,它可以通过形成至少三种反应中间体,共价修饰 Mpro中更多具有功能的半胱氨酸(如 Cys44、Cys145),从而更有效地抑制 Mpro的活性。

研究人员系统地研究了黄酮类化合物作为 SARS-CoV-2 Mpro抑制剂的构效关系,成功发现了新型溴代黄芩素衍生物 BA-21 这种高效的共价抑制剂。这一研究不仅明确了黄酮类化合物抗 Mpro活性的关键结构特征,还为开发更有效的抗 SARS-CoV-2 药物奠定了坚实基础。在新冠疫情仍在全球范围内肆虐的当下,该研究成果为抗击疫情带来了新的希望,有助于推动抗新冠药物的研发进程,为保护公众健康提供更有力的支持。

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