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血管疾病危害全球健康,准确的血管分析至关重要。研究人员开发 VesselKnife 软件,用于解决血管半径估计和 3D 重建难题。该软件在合成数据和真实成像中表现出色,是可靠的医学影像工具,有助于推动相关研究发展。
在全球范围内,血管疾病如心脏病发作、中风和动脉瘤破裂等,都是导致人类死亡的主要原因。这些疾病的发展和严重程度与血管的几何结构和布局密切相关。医学成像技术,像计算机断层血管造影(CTA)和磁共振血管造影(MRA),虽然能让医生在体内详细观察血管网络,辅助诊断和治疗,但在血管图像分析中,准确估计血管半径仍是一大挑战。这一数据是构建三维(3D)血管模型的基础,对检测血管狭窄、动脉瘤等病变至关重要。
当前市面上的血管建模软件,无论是开源的如 SimVascular、ITK - SNAP、3D Slicer,还是商业软件如 Mimics Innovation Suite、Amira,都存在一定的局限性。开源软件中,有的使用难度大,有的无法满足特定需求;商业软件则存在代码封闭,不利于研究人员开发新算法的问题。而且,现有的 3D 建模流程,从初始图像增强、血管分割,到构建表面模型、计算中心线和估计半径,中间步骤多,易引入误差,在处理细血管时问题尤为突出。因此,开发一款能直接从原始光栅图像估计血管半径、减少误差的软件迫在眉睫。
国外研究人员开发了 VesselKnife 这一开源软件项目,旨在填补当前血管建模工具的空白。该研究成果发表在《Computer Methods and Programs in Biomedicine》。
研究人员在 VesselKnife 中运用了多种关键技术方法。一方面,基于多尺度血管性函数(这是利用局部计算的 Hessian 矩阵来增强血管与周围组织对比度的方法),从 Erdt、Frangi 和 Sato 提出的方法中选择合适算法计算该函数;另一方面,借助主成分分析(Principal Component Analysis)来估计血管半径并确定管腔方向。研究中使用了合成的 3D 管状结构图像和真实的 MRI、CT 医学成像数据,通过对比分析评估软件性能。
研究结果
- 合成数据实验结果:在合成数据实验中,VesselKnife 表现出高准确性。对于小血管,其半径估计误差在 2.3% - 5.7% 之间;对于较大血管,误差可达 2.9%。同时,该软件对噪声具有较强的鲁棒性,能可靠地分割细血管段。
- 真实成像应用结果:在真实成像场景下,VesselKnife 在模拟大脑和肾脏血管方面效果显著。此外,它还能应用于共聚焦显微镜成像和支架建模,展示了对多种成像方式的适应性。
研究结论和讨论
VesselKnife 凭借精确的半径估计和在不同成像条件下的强大性能,有效解决了血管建模中的关键问题。它不仅为研究人员和生物医学成像从业者提供了可靠的工具,其应用潜力还远超血管研究领域。而且,研究中发布的合成 3D 图像数据库,为后续研究的可重复性提供了保障,推动了相关领域的进一步探索。VesselKnife 的出现,为血管疾病的研究、诊断和治疗带来了新的思路和方法,在医学影像分析领域具有重要的意义,有望在未来助力更多相关研究取得突破,为人类健康事业做出贡献。