编辑推荐:
为探寻卵巢癌有效生物标志物,研究人员对 60 例浆液性卵巢腺癌患者及 20 例无癌症病史女性尿液样本进行代谢组学和 microRNA 转录水平研究。发现 26 种化合物浓度异常,确定相关调控关系,筛选出潜在无创诊断标志物,为卵巢癌诊断提供新方向。
在卵巢恶性肿瘤研究领域,寻找高效的卵巢癌生物标志物是妇科肿瘤学当下的热门趋势之一。超高效液相色谱 - 质谱联用技术(UHPLC-MS)进行的代谢谱分析,能获取患者生物流体样本中低分子量代谢物的全套信息,这些代谢物或许可成为潜在的疾病标志物,将其与微小 RNA(miRNA)水平数据相结合,能显著提升诊断价值。
为识别浆液性卵巢腺癌潜在的无创诊断标志物,研究人员对患者尿液样本中的代谢组学特征和 miRNA 转录水平展开研究。该研究纳入了 60 例确诊为浆液性卵巢腺癌的患者,以及 20 例无癌症病史的女性。研究借助 Vanquish Flex UHPLC 系统与 Orbitrap Exploris 480 质谱仪联用,对代谢物进行色谱分离。运用随机森林机器学习方法,探寻代谢物的基因调控因子和基因的 miRNA 调控因子。通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)测定尿液中的 miRNA 转录水平,并利用 LASSO 惩罚逻辑回归构建预测模型。
研究发现,与对照组相比,卵巢癌(OC)患者尿液中有 26 种化合物浓度异常,包括犬尿氨酸、苯丙氨酰缬氨酸、溶血磷脂酰胆碱(18:3、18:2、20:4 和 14:0)、丙氨酰亮氨酸、L - 苯丙氨酸、磷脂酰肌醇(34:1)、5 - 甲氧基色氨酸、2 - 羟基肉豆蔻酸、3 - 氧代胆酸、吲哚丙烯酸、溶血磷脂酰丝氨酸(20:4)、L - β - 天冬氨酰 - L - 苯丙氨酸、肉豆蔻酸、癸酰肉碱、天冬氨酰甘氨酸、丙二酸单酰肉碱、3 - 羟基丁酰肉碱、3 - 甲基黄嘌呤、2,6 - 二甲基庚酰肉碱、3 - 氧代十二烷酸、N - 乙酰脯氨酸、L - 辛酰肉碱和辛酰甘氨酸。通过随机森林方法,建立了代谢物 - 基因调控因子(47 个基因)和代谢物 - miRNA 调控因子(613 个独特 miRNA)之间的关系。经 qPCR 验证,有 85 种 miRNA 的水平发生变化。在 OC 患者中,与对照组相比,miR - 382 - 5p、miR - 593 - 3p、miR - 29a - 5p、miR - 2110、miR - 30c - 5p、miR - 181a - 5p、let - 7b - 5p、miR - 27a - 3p、miR - 370 - 3p、miR - 6529 - 5p、miR - 653 - 5p、miR - 4742 - 5p、miR - 2467 - 3p、miR - 1909 - 5p、miR - 6743 - 5p、miR - 875 - 3p、miR - 19a - 3p、miR - 208a - 5p、miR - 330 - 5p、miR - 1207 - 5p、miR - 4668 - 3p、miR - 3193、miR - 23a - 3p、miR - 12132、miR - 765、miR - 181b - 5p、miR - 4529 - 3p、miR - 33b - 5p、miR - 17 - 5p、miR - 6866 - 3p、miR - 4753 - 5p、miR - 103a - 3p、miR - 423 - 5p、miR - 491 - 5p、miR - 196b - 5p、miR - 6843 - 3p、miR - 423 - 5p 和 miR - 3184 - 5p 的转录水平均出现改变。
由此可见,OC 患者尿液中存在显著的代谢组失衡,且这与调控代谢物信号通路的 miRNA 水平变化相关。尿液中这 26 种浓度异常的化合物,以及 miR - 33b - 5p、miR - 423 - 5p、miR - 6843 - 3p、miR - 4668 - 3p、miR - 30c - 5p、miR - 6743 - 5p、miR - 4742 - 5p、miR - 1207 - 5p 和 miR - 17 - 5p 的水平,被认为适合作为 OC 的无创诊断标志物。