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为解决沙蝇传播的白蛉病毒(SbPV)检测缺乏标准化工具、相关研究受限等问题,研究人员开展了外部质量评估(EQA)研究。9 个实验室参与,结果显示特定 RT-qPCR 检测 TOSV 和 SFSV 灵敏度高,泛白蛉病毒检测率较低。该研究有助于提升病毒监测水平。
在神秘的病毒世界里,有一种病毒正悄悄影响着人类的健康,它就是沙蝇传播的白蛉病毒(Sand fly-borne phleboviruses,SbPV)。这类病毒分布广泛,然而我们对它们的了解却十分有限。虽然近年来检测到的病例有所增加,但关于它们的生态特征、对健康的影响等方面,还有许多未知等待探索。由于缺乏足够的认知和标准化的筛查手段,很多 SbPV 感染病例都未被发现或被误诊。同时,现有的诊断工具也不够完善,没有能够检测所有 SbPV 的通用方法,这严重阻碍了对这类病毒的全面监测。在这样的背景下,开展针对 SbPV 的深入研究迫在眉睫。
来自多个国家的研究人员在欧盟 CLIMOS(EU Climate Monitoring and Decision Support Framework for Sand Fly-borne Diseases Detection and Mitigation)项目的框架下,开展了一项外部质量评估(External Quality Assessment,EQA)研究。他们的目标是评估和提高实验室对 SbPV 的检测能力,为研究气候变化和环境因素对沙蝇及所携带微生物的影响提供可靠数据。
研究人员选取了来自 7 个国家的 9 个实验室参与此次 EQA。每个实验室都收到了包含不同样本的 8 个小瓶、用于检测 Toscana 病毒(TOSV)和西西里白蛉热病毒(SFSV)的冻干引物和探针,以及用于检测泛白蛉病毒的引物和标准操作流程。
在研究过程中,研究人员用到了多种关键技术方法。首先是核酸提取技术,不同实验室使用了不同厂家的提取试剂盒,如 Qiagen、Resnova、Promega 等 。其次是 PCR 技术,包括实时逆转录定量 PCR(RT-qPCR)和常规逆转录 PCR(RT-PCR),各实验室使用的 PCR 试剂盒也有所差异。
研究结果如下:
- EQA 参与情况:对 9 个实验室的结果进行了分析。
- 核酸提取:各实验室使用的核酸提取试剂盒和起始体积不同,5 个实验室使用 Qiagen 的试剂盒,其中 4 个采用手动方法。
- 实时 RT-qPCR 分子检测方法:实验室使用的实时 RT-qPCR 试剂盒种类多样,5 个实验室使用 Thermo Fisher Scientific 的 RT-qPCR 一步法 SuperScript III Platinum 试剂盒。
- 常规 RT-PCR 分子检测方法:6 个实验室使用 Thermo Fisher Scientific 的不同试剂盒。
- 实时 RT-qPCR 和常规 RT-PCR 结果:所有实验室都成功检测出 TOSV 阳性样本,但 Ct 值存在差异;所有实验室也成功检测出 SFSV 阳性样本;在泛白蛉病毒检测中,只有 1 个实验室成功检测出所有 6 个样本。
- 检测成功率评估:TOSV 三重检测和泛 SFSV 检测的成功率均为 100%,而泛白蛉病毒检测的成功率在 33.3% - 100% 之间,整体检测成功率在 77.7% - 100% 之间。
研究结论和讨论部分表明,此次 EQA 成功实现了 9 个实验室对 SbPV 分子检测的标准化,获得了可用于气候和环境影响建模的可比数据。特定的 RT-qPCR 检测 TOSV 和 SFSV 具有高灵敏度,而泛白蛉病毒 RT-PCR 检测虽灵敏度较低,但在更广泛的病毒检测方面有价值。此外,研究还发现手动提取 RNA 的实验室 Ct 值较高,可能存在 RNA 损失。该研究不仅评估了实验室的检测能力,还加强了分子检测能力,促进了国际合作,为应对新兴传染病、保障全球健康安全做出了重要贡献。