全转录组 RNA 测序揭示菜豆应对干旱胁迫的分子机制

干旱严重限制菜豆生长，为筛选耐旱基因并解析其调控机制，研究人员利用全转录组 RNA 测序分析菜豆幼苗在干旱胁迫（DS，50 mmol?L?1甘露醇处理 24 h 和 48 h）下转录组变化。鉴定出多种差异表达 RNA，并构建 ceRNA 网络，为研究 lncRNA 和 circRNA 功能奠定基础。

　　菜豆（Phaseolus vulgaris L.）是人类食用的主要豆类作物之一。干旱是限制菜豆生长的最重要非生物胁迫因素。菜豆的耐旱性是一个复杂的特征，由众多基因调控。筛选耐旱基因并分析其调控机制是精准培育耐旱品种的基础。在本研究中，利用全转录组 RNA 测序技术，分析了菜豆幼苗在干旱胁迫（DS，用 50 mmol?L^?1甘露醇处理 24 小时和 48 小时）下的动态转录组变化。在干旱胁迫 24 小时和 48 小时的条件下，分别鉴定出 3897 个和 5222 个差异表达（DE）的信使核糖核酸（mRNA）、695 个和 883 个差异表达的长链非编码核糖核酸（lncRNA）、20 个和 61 个差异表达的微小核糖核酸（miRNA）、4 个和 5 个差异表达的环状核糖核酸（circRNA）。利用预测的差异表达配对构建竞争性内源 RNA（ceRNA）网络，展示了干旱胁迫下的调控功能。功能分析表明，ceRNA 与多聚半乳糖醛酸酶活性、甾醇生物合成以及植物激素信号转导有关。总之，首次对干旱胁迫下的菜豆进行了全转录组分析，为研究 lncRNA 和 circRNA 的潜在功能提供了基础。