解析花生红种皮奥秘：AhRt3 基因编码花青素还原酶的关键作用

为探究花生红种皮的遗传机制，研究人员构建 F2群体开展研究。发现红种皮由 AhRt3 基因控制，该基因被定位到 125.30kb 区域，编码花青素还原酶的 Arahy.W8TDEC 基因可能是候选基因。此研究有助于了解花生种皮遗传基础。

　　种皮颜色是花生（Arachis hypogaea L.）的一个特殊性状。近年来，深色种皮的花生因其高花青素含量和增强的抗氧化营养价值而受到关注。然而，这一性状背后的遗传机制仍不明确。为了确定导致花生红种皮颜色的基因，研究人员将 YH91（粉色种皮）与 JHT1（红色种皮）杂交构建了 F₂群体。遗传分析表明，红种皮由一个名为 AhRt3（Arachis hypogaea Red Testa 3）的单显性基因控制。通过分离群体分组分析法测序（bulked segregant analysis sequencing），AhRt3 基因被初步定位到 Arahy.03 染色体上，随后缩小到一个 125.30kb 的基因组区域，该区域包含 12 个潜在的候选基因。RNA 测序（RNA-seq）分析显示，种子种皮中有 4880 个基因差异表达，只有候选基因 Arahy.W8TDEC 在 JHT1 中的表达水平高于 YH91。此外，序列变异、功能注释和表达谱分析证实，编码花青素还原酶（anthocyanin reductase）的 Arahy.W8TDEC 基因可能是 AhRt3 的候选基因。Arahy.W8TDEC 基因第六外显子和 3’非翻译区（3’UTR）之间的倒位结构变异导致了氨基酸的改变，这与花生红种皮表型密切相关。总之，这项研究揭示了一个新基因在调节花生红种皮中的作用，为深入了解花生种子种皮的遗传基础提供了有价值的见解。