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为探究乳腺癌脑转移（BrM）的基因组改变及免疫微环境影响，杜克大学研究人员对 42 例患者进行研究。发现 BrM 和 ECT 存在异同，且部分基因通路与生存相关。该研究有助于开发针对性治疗策略。
在癌症治疗领域，乳腺癌一直是备受关注的焦点。随着医疗技术的进步，转移性乳腺癌（MBC）患者的生存期有所延长，但脑转移（BrM）的问题却日益凸显。据统计，HER2 阳性（HER2
+）、三阴性乳腺癌（TNBC）患者发生脑转移的概率颇高，分别达到 31% 和 32%，而这部分患者一旦出现中枢神经系统（CNS）复发，预后往往很差，总体生存率显著降低。目前，虽然针对脑转移的研究不断推进，但仍存在诸多未解之谜，比如驱动 CNS 复发的基因组改变尚不明确，免疫微环境在其中的作用，尤其是不同内在亚型中的差异，也有待深入探索。正是在这样的背景下，杜克大学的研究人员开展了一项极具意义的研究，旨在揭开乳腺癌脑转移的神秘面纱，相关成果发表在《Acta Neuropathologica Communications》上。
研究人员为深入剖析乳腺癌脑转移的奥秘，采用了多种关键技术方法。他们收集了 42 例乳腺癌脑转移患者的样本，包括冷冻和福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）的脑转移瘤（BrM）组织、FFPE 的颅外肿瘤（ECT）组织以及部分患者匹配的血液 DNA 样本。运用全外显子测序（WES）技术分析 DNA，探究基因突变和拷贝数变异；通过总 RNA 测序（RNAseq）研究基因表达情况；借助生物信息学和生物统计学方法对数据进行全面分析，如推断 PAM50 内在亚型、评估免疫细胞浸润等。
下面来看看具体的研究结果。在患者和样本队列特征方面，42 例患者中多数为女性，年龄中位数在初诊乳腺癌和脑转移手术时分别为 48 岁和 53 岁。临床亚型多样，包括 ER/PR（HR）+HER2-、HER2+、HR-HER2-等。大部分脑转移瘤标本为新诊断，且多未接受治疗。
在内在和临床亚型分类及一致性上，研究发现多数 FFPE ECT 和 FFPE BrM 样本的内在亚型匹配，但仍有部分不一致，LumB 和 Normal 亚型的样本间不一致情况较多。同时，PAM50 推断的亚型与临床亚型之间存在差异，不过 HER2 扩增 / 富集等关键特征基本一致。
从突变和体细胞拷贝数改变来看，BrM 和 ECT 的肿瘤突变负荷（TMB）总体相似，但 BrM 有更高的趋势。TP53 是最常发生改变的基因。拷贝数变异分析显示，不同 PAM50 亚型和临床亚型的 BrM 样本存在独特的染色体区域增减，涉及许多关键基因。
基因和通路表达分析表明，与 ECT 相比，BrM 中有 457 个基因差异表达。基因集富集分析（GSEA）显示，BrM 中 MYC 靶基因、氧化磷酸化等通路表达增加，而 ECT 中免疫相关通路表达更高。
免疫景观分析发现，与 ECT 相比，BrM 中仅活化的树突状细胞比例更高。不同样本类型和亚型之间，免疫细胞比例差异不显著。
时间 - 事件分析显示，从初始诊断到开颅手术的时间因内在亚型而异，部分基因集富集与较差的生存结局相关。临床亚型也与生存时间相关，HR-HER2-和 HR-HER2+患者生存时间较短。
综合研究结果和讨论部分，该研究全面描述了乳腺癌脑转移的基因组和免疫景观。虽然部分基因组改变在 BrM 和 ECT 中共享，但 BrM 在体细胞突变、CNV、通路改变和免疫景观等方面存在独特之处。这些发现为深入理解乳腺癌脑转移的发病机制提供了重要依据，有助于开发针对乳腺癌脑转移的精准治疗策略，为改善患者预后带来了新的希望。不过，研究也存在一定局限性，如样本量较小、存在选择偏倚等，后续还需更大规模、多机构的研究进一步验证和深入探索。
