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为探究与人类密切关联的野生鸟类肠道微生物组区域差异及人畜共患病潜力，研究人员对尼日利亚南北地区乡村织雀（Ploceus cucullatus）粪便样本开展高通量 16S rRNA 测序。发现南北肠道菌群差异显著（p＜0.05），均含重要病原体，该研究为病原体传播防控提供依据。
与人类密切相关的野生鸟类可能作为人畜共患病原体的储存宿主。乡村织雀（Ploceus cucullatus）是撒哈拉以南非洲广泛分布的雀形目鸟类，栖息于多种生态位，但其肠道微生物组及对病原体传播的作用尚不清楚。本研究比较尼日利亚北部和南部乡村织雀种群的肠道微生物组，以确定区域差异和人畜共患病潜力。通过高通量 16S rRNA 测序分析两个种群的粪便样本。分类学分析显示，北部肠道微生物组中肠杆菌科（Enterobacteriaceae，95.94%；包括阴沟肠杆菌、大肠杆菌、肠炎沙门氏菌、肺炎克雷伯菌）占优势，而南部肠道微生物组中弯曲菌科（Campylobacteraceae，70.30%；拉里弯曲菌）和支原体科（Mycoplasmataceae，28.17%；穿透支原体）占主导。肠道微生物组的统计分析显示，南北地区在所有分类层级上均存在显著差异（p＜0.05）。北部肠道微生物组中检测到具有公共卫生意义的致病菌株，如阴沟肠杆菌阴沟亚种 ATCC 13047、大肠杆菌 O157:H7、O104:H4、O44:H18、O145:H28、O6:H16 血清型，以及肠炎沙门氏菌亚种的多个血清型（Newport、Havana、Typhimurium、Enteritidis、1,4,[5],12:i:-、Indiana、Montevideo、Hvittingfoss、Heidelberg、Typhi），而穿透支原体仅在南部肠道微生物组中检测到。研究结果表明，区域特异性适应和环境条件调节和塑造了乡村织雀的肠道微生物组。由于其广泛的摄食习性，该物种可能通过粪 - 口途径成为人畜共患病原体有效传播和扩散的媒介。
