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间充质干细胞（MSCs）的免疫调节活性至关重要。脂肪来源干细胞（ASCs）因高免疫抑制活性具治疗潜力。为明确脂肪基质血管成分（SVF）中 ASCs 的异质性免疫调节潜力，研究整合单细胞 RNA 测序（scRNA seq）与蛋白质组学，鉴定出表型类似细胞因子刺激 ASCs 的亚群，为细胞治疗提供新方向。
间充质干细胞（MSCs）的主要治疗特性之一是其免疫调节活性。脂肪来源干细胞 / 基质细胞（ASCs）作为间充质干细胞的丰富且易于分离的来源，表现出高免疫抑制活性，使其在治疗应用中具有吸引力。了解脂肪组织基质血管成分（SVF）中 ASCs 的异质性免疫调节潜力可更好地为治疗策略提供信息。在本研究中，研究人员整合单细胞 RNA 测序（scRNA seq）与整体蛋白质组学，以表征 SVF 来源的 ASCs 中亚群，这些亚群在表型上与细胞因子激活的培养 ASCs 相似。为了更好地定义激活过程，研究提供了暴露于炎症细胞因子的培养（P2）ASCs 的 scRNA seq 和整体蛋白质组学数据，显示与炎症和细胞凋亡相关的通路富集，这些通路与细胞因子介导的、轨迹衍生的伪时间呈正相关。使用 Scissor 算法，研究人员将蛋白质组学数据与未培养（P0）SVF 的 scRNA seq 数据整合，鉴定出一个表型类似于细胞因子刺激 ASCs 的 ASC 亚群（Scissor 阳性）。互作组分析表明，Scissor 阳性 ASCs 是应激适应性免疫调节因子，通过 IL6 和广泛的 SEMA4 相互作用以及更高的内脂素信号发挥作用，而 Scissor 阴性 ASCs 则通过 FN1 显示出细胞外基质（ECM）重塑的强烈特征，并通过 THY1 和 MIF 信号显示免疫抑制特征。这种多模式整合方法能够鉴定出先前未被识别的、具有不同免疫调节表型的独特 ASC 亚群，这些亚群存在于 P0 SVF ASCs 中，并有可能从中进行筛选。
