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本综述系统探讨影像遗传学在神经系统疾病中的方法与应用,整合基因(如 APOE、C9orf72)与神经影像(如基于体素的形态测量学 VBM)数据,分析其在疾病机制解析和精准医学中的潜力,为个性化诊疗提供新思路。
影像遗传学作为精准医学(PM)的重要组成部分,通过整合基因组数据(如全基因组关联研究 GWAS)与神经影像技术(如正电子发射断层扫描 PET、磁共振成像 MRI),深入探究遗传变异对脑结构和功能的影响,为神经系统疾病的机制解析和个性化治疗提供了新方向。
研究方法与流程
影像遗传学研究通常包括五个关键步骤:
- 假设形成:基于基因组结构或基因活性变化可能影响脑结构、功能或连接的理念,明确特定遗传变异(如单核苷酸多态性 SNPs)与脑成像表型的可测试关联,同时确定神经影像类型(如结构 MRI 评估脑萎缩、功能 MRI 研究神经网络活动)。
- 数据获取:利用大型数据集如英国生物银行(UK Biobank)、人类连接组计划(HCP)等获取基因型和神经影像数据,涵盖多种神经系统疾病和正常人群。
- 数据预处理与分析:
- 影像处理:通过空间归一化、分割、平滑等操作对神经影像数据进行预处理,提取脑体积、功能连接等特征,常用工具包括统计参数映射(SPM)、FMRIB 软件库(FSL)、FreeSurfer 等。
- 基因数据分析:进行质量控制、基因分型和插补,运用 GWAS 或候选基因方法等统计分析手段识别与特定脑特征相关的遗传变异,工具如 PLINK、基因组复杂性状分析(GCTA)等。
- 统计分析:采用方差分析(ANOVA)、t 检验、多元回归分析、广义线性模型(GLM)等方法评估遗传变异与脑特征的关联。
- 验证与解释:通过在独立数据集上重现关联结果进行验证,结合 meta 分析增强统计效力,阐释遗传效应的大小和方向。
主要研究成果
本综述系统分析了 28 项研究,涵盖额颞叶痴呆(FTD)、阿尔茨海默病(AD)、双相情感障碍、精神分裂症、帕金森病(PD)等多种神经系统疾病。
- 常用技术与基因:基于体素的形态测量学(VBM)是最常用的神经影像技术,常见遗传变异包括 APOE、C9orf72、MAPT、GRN、COMT、BDNF 等。这些变异与区域灰质损失(如额叶、颞叶或皮层下区域)相关,表明遗传风险因素在疾病病理生理学中起关键作用。
- 疾病特异性发现:
- 额颞叶痴呆:不同基因突变(C9orf72、MAPT、GRN、SQSTM1 等)与特定脑区萎缩模式相关,如 C9orf72 突变与左额叶皮质萎缩、小脑萎缩相关;GRN 突变与纹状体、后额叶和顶叶灰质减少相关。
- 阿尔茨海默病:SORL1 rs3824968 等位基因 A、BDNF val66met 多态性、TREM2 p.R47H 变异等与特定脑区灰质体积减少或皮层厚度变化相关,影响疾病风险和认知功能。
- 双相情感障碍:IL1B 基因 rs16944 和 rs1143627 SNPs、ANK3 基因变异(rs10761482)与脑区体积变化和年龄相关脑萎缩有关。
- 帕金森病:SNCA 基因 rs356219 SNP、LRRK2 突变与脑区功能连接改变相关,即使在无症状突变携带者中也存在功能连接异常。
- 其他疾病:精神分裂症、酒精使用障碍、自闭症谱系障碍等疾病中,特定基因变异与脑结构和功能异常相关。
挑战与展望
尽管影像遗传学取得了显著进展,但仍面临诸多挑战:
- 样本量与异质性:许多研究样本量较小,影响统计效力和结果的可推广性;成像技术和基因分析方法的异质性限制了跨研究比较。
- 多模态整合与技术应用:多模态成像整合不足,机器学习等先进技术应用有限,难以捕捉复杂的基因 - 脑表型关系。
- 临床转化:遗传变异与脑表型的关联尚未充分转化为临床实践,需结合多组学数据和纵向研究,开发可靠的生物标志物和个性化治疗策略。
未来研究应通过大型协作联盟(如 ENIGMA、UK Biobank)扩大样本量,采用标准化成像协议,利用机器学习分析高维遗传和影像数据,加速向临床实践的转化,推动个性化神经学和精神病学的发展。