肠道菌群通过树突状细胞DNA甲基化调控介导环境颗粒物诱发哮喘的机制研究

【字体: 时间:2025年05月15日 来源:Cell Reports 7.5

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  这篇研究揭示了孕期环境颗粒物(CAP/DEP)暴露通过改变子代肠道菌群组成,经菌群移植(GMT)可诱导受体小鼠出现哮喘易感性,该效应依赖活菌并通过降低丁酸水平、改变树突状细胞(DC)DNA甲基化模式实现。研究首次证实活体肠道菌群在环境暴露诱发哮喘中的因果作用,为哮喘起源的"菌群-表观遗传"轴提供机制解释。

  

GMT confers asthma predisposition
孕期暴露于城市浓缩颗粒物(CAP)或柴油颗粒物(DEP)的母鼠,其子代通过粪便菌群移植(GMT)可将哮喘易感性传递给无菌受体小鼠。实验采用"低剂量过敏原(OVA)方案":受体小鼠在接受GMT后,仅需单次腹腔致敏和3天气雾激发即出现支气管肺泡灌洗液(BAL)嗜酸性粒细胞增多、IL-4/IL-5/IL-13升高及肺组织浸润等典型哮喘表型,与直接暴露组表型相似度达90%。值得注意的是,该效应具有菌群特异性——来自PBS暴露母鼠子代的GMT不诱发任何病理改变。

A viable microbiome is required for asthma predisposition
通过γ射线灭菌(50kGy/24h)或联合抗生素(环丙沙星+甲硝唑)处理GMT材料后,其诱导哮喘的效应完全消失。特别设计的对照实验证实,抗生素处理仅影响移植菌群的定植过程,对受体自身免疫状态无直接影响。这一结果明确提示:活菌的存在是GMT传递哮喘易感性的必要条件,排除了单纯细菌代谢产物或可溶性因子介导效应的可能性。

Metagenomic sequencing detects partial microbiome remodeling
宏基因组测序揭示了CAP/DEP暴露组的特征性菌群改变:产丁酸的Alistipes timonensis和Lachnospiraceae bacterium UBA3282等菌种丰度降低>1%,而Acetatifactor、Butyribacter等潜在致病菌显著增加。KEGG分析显示4-羟基丁酰辅酶A脱水酶(abfD)等丁酸合成相关基因下调,与代谢组学检测到的粪便丁酸水平降低(降幅达40%)相互印证。值得注意的是,这些改变在GMT受体小鼠中呈现时间依赖性重建,R3时间点(移植后第14天)的菌群结构和代谢物谱与供体高度一致。

The epigenome of the recipient host's DCs is altered by GMT
全基因组DNA甲基化芯片分析发现:CAP暴露组与GMT受体组的树突状细胞(DC)共享935个差异甲基化位点(DMLs),而γ灭菌GMT组则无此特征。MetaCore通路分析显示这些位点富集于IL-4/IL-12信号、抗原呈递、WNT/NOTCH通路等过敏相关进程。特别引人注目的是,组蛋白去乙酰化酶(HDAC)和DNA甲基转移酶(DNMT)相关基因的甲基化改变,为丁酸(已知的HDAC抑制剂)缺乏导致表观遗传失调提供了分子解释。

The epigenetically altered DCs are pro-allergy in co-culture with T cells
功能验证实验采用DO11.10小鼠(OVA特异性TCR转基因)的CD4+ T细胞与哮喘易感组DC共培养。结果显示:易感组DC呈递OVA抗原的效率较正常组提高2.3倍,诱发T细胞增殖反应显著增强(p<0.005)。而DNA甲基化抑制剂(地西他滨或泽布拉林)处理可完全逆转这种异常抗原呈递,证实表观遗传修饰直接调控DC的致敏性。对照药物阿糖胞苷(无表观调控活性)则无此效应,排除非特异性药物干扰。

这项研究首次建立"环境颗粒物-肠道菌群-表观遗传-DC功能"的完整因果链条,创新性地证明:1)孕期环境暴露通过改变子代菌群诱发跨代哮喘风险;2)该效应依赖活菌定植而非单纯代谢产物;3)丁酸代谢紊乱可能是连接菌群改变与DC表观遗传 reprogramming 的关键介质。这些发现为哮喘预防提供了新靶点——通过调控特定菌群或其代谢产物干预表观遗传编程,或可阻断环境暴露导致的过敏易感性传递。

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