FAN1 R507H 突变通过影响 PCNA 介导的 DNA 组装加速亨廷顿病进展的机制研究

【字体: 时间:2025年05月15日 来源:Nature Communications 14.7

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  亨廷顿病(HD)中 FAN1 R507H 突变与早发性运动功能障碍相关,机制不明。研究人员解析 PCNA-FAN1-DNA 复合物冷冻电镜结构,发现 R507H 破坏 FAN1 与 PCNA 的盐桥作用,削弱复合物稳定性,为 HD 进展机制提供新解释。

  
亨廷顿病(Huntington’s disease, HD)是一种由 huntingtin 基因(HTT)中 CAG 三核苷酸重复序列扩增导致的神经退行性疾病,患者体细胞中 HTT-CAG 重复序列的进一步扩增是疾病进展的必要条件。CAG 重复长度与运动功能障碍的发病年龄相关,携带更长 CAG 重复序列的个体更易在年轻时发病。全基因组关联研究发现,包括 FAN1 在内的多个参与 DNA 错配修复(MMR)的基因与 HD 发病年龄相关,其中 FAN1 R507H 编码变异与运动功能障碍的早发显著相关,但潜在机制尚不明确。

为探究 FAN1 R507H 突变加速 HD 进展的机制,Proteros biostructures GmbH 和 CHDI Management, Inc 的研究人员开展了一系列研究。他们通过解析 PCNA-FAN1-DNA 复合物的冷冻电镜结构,结合生物物理相互作用研究和核酸酶活性测定,揭示了 FAN1 与 PCNA 的相互作用机制及 R507H 突变的影响,相关研究发表在《Nature Communications》。

研究中用到的主要关键技术方法包括:冷冻电镜(cryo-EM),用于解析 FAN1 野生型及 R507H 突变体与 PCNA、DNA 形成的复合物结构;表面等离子体共振(SPR)和微尺度热泳(MST),用于研究蛋白质与 DNA 及蛋白质间的相互作用和亲和力;核酸酶活性测定,评估 PCNA 对 FAN1 活性的调节作用。

结果


FAN1 通过 R507 与 PCNA、DNA 形成三元复合物


冷冻电镜结构显示,野生型 FAN1 与 PCNA、5′ flap 双链 DNA 形成三元复合物时,FAN1 的 R507 与 PCNA 的 D232 直接相互作用,形成盐桥稳定复合物界面。而在 FAN1 R507H 突变体与 PCNA、DNA 的复合物中,H507 与 D232 的距离增加,盐桥作用被破坏,同时 PCNA 发生构象改变。这表明 R507H 突变削弱了 FAN1 与 PCNA 的相互作用。

FAN1-PCNA 相互作用依赖 DNA 底物且影响复合物稳定性


生物物理实验表明,PCNA 与 FAN1 结合 DNA 后的亲和力显著提高,FAN1 R507H 或 PCNA D232A 突变会降低这种亲和力,且复合物的稳定性与 DNA 底物相关。对于含(CAG)2 额外螺旋 extrusion 的 DNA 底物,三元复合物的解离速率最慢,稳定性最高。

PCNA 调节 FAN1 活性依赖复合物形成


核酸酶活性测定显示,PCNA 对 FAN1 活性的调节取决于复合物的形成。在含(CAG)2-4 额外螺旋 extrusion 的 DNA 底物上,PCNA 可激活野生型 FAN1 的核酸酶活性,而 FAN1 R507H 或 PCNA D232A 突变会削弱这种激活作用,表明 FAN1-PCNA 相互作用界面是 PCNA 激活 FAN1 的关键。

结论与讨论


本研究揭示了 FAN1 R507H 突变加速 HD 进展的机制:R507H 突变破坏了 FAN1 与 PCNA 之间的盐桥作用,削弱了三元复合物的稳定性,导致 FAN1 对含 CAG 重复序列的 DNA 修复能力下降,进而促进 CAG 重复序列的扩增。这一发现为 HD 的发病机制提供了新的见解,提示 FAN1-PCNA 相互作用界面可能成为潜在的治疗靶点。未来可通过开发变构激活剂增强 FAN1 与 PCNA 的相互作用,为 HD 治疗提供新策略。研究结果也为理解其他三核苷酸重复扩增疾病的机制提供了参考。

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