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为解析红曲醋生物膜微生物组成及挖掘细菌纤维素(BC)生产菌株,研究人员通过宏基因组测序分析其菌群,并分离鉴定出欧洲驹形杆菌 FMES。该菌株利用 5% 甘油时 BC 产量达 5.89±0.38 g/L,3% 乙醇可促进合成,为 BC 生产及菌群研究提供新方向。
细菌纤维素(BC)作为一种具有高纯度、高结晶度和独特纳米纤维网络结构的生物材料,在生物医药、食品包装等领域展现出巨大应用潜力。然而,目前 BC 生产菌株主要来源于水果或传统发酵食品,对红曲醋这类特色发酵体系的微生物资源挖掘不足。红曲醋是中国四大名醋之一,其生物膜在发酵过程中形成,却缺乏对其中产 BC 菌株的系统研究。因此,探索红曲醋生物膜中的微生物组成,分离高效产 BC 菌株,并解析其代谢机制,对拓展 BC 生产来源和提升发酵食品微生物资源利用具有重要意义。
福建某研究机构的研究人员针对这一问题,开展了红曲醋生物膜微生物组及产 BC 菌株的研究。研究成果发表在《Carbohydrate Polymer Technologies and Applications》,为 BC 生产和红曲醋发酵机制提供了新见解。
研究采用的关键技术包括:宏基因组测序分析生物膜微生物群落结构,通过平板分离和 16S rDNA 测序从生物膜中筛选鉴定产 BC 菌株,利用全基因组测序解析菌株的碳代谢和 BC 合成通路,通过静态发酵优化碳源(甘油、乙醇等)对 BC 产量的影响,并结合多种理化表征技术(如 XRD、ATR-FTIR、SEM 等)验证 BC 的结构和性能。
3.1 红曲醋生物膜微生物群落分析
通过 Illumina 高通量测序,在红曲醋生物膜中检测到 16 个门、24 个纲、46 个目、70 个科、122 个属和 305 个种。其中,醋杆菌科(Acetobacteraceae)为优势菌群(平均相对丰度 96.43%),欧洲驹形杆菌(K. europaeus)是最主要物种(50.88%),表明该生物膜富含醋酸菌,具备产 BC 潜力。功能基因注释显示,代谢相关基因占比最高,尤其是碳水化合物代谢和多糖合成相关基因,进一步支持了 BC 合成的可能性。
3.2 产 BC 菌株的分离与鉴定
从生物膜中分离出 5 株产 BC 菌株,其中 FMES 菌株产量最高。通过 16S rDNA 测序和 31 个管家基因系统发育分析,确认其为欧洲驹形杆菌新菌株。该菌株在 HS 培养基中形成凝胶状膜,经 XRD、ATR-FTIR 和 13C CP MAS NMR 等分析,证实其产物为典型纤维素 I 结构的 BC,纯度达 96.97±0.64%,结晶度 75.14±0.16%,纳米纤维平均宽度 37.60±16.45 nm。
3.3 基因组与代谢通路分析
全基因组测序显示,FMES 菌株基因组包含 1 条染色体和 3 个质粒,GC 含量 61.25%。碳代谢通路分析表明,菌株可通过戊糖磷酸途径代谢葡萄糖,利用甘油、乙醇等碳源。BC 合成由 3 个 bcs 操纵子(bcsⅠ、Ⅱ、Ⅲ)调控,其中 bcsA 基因含 PilZ 结构域,受环二鸟苷酸(c-di-GMP)调控,揭示了其 BC 合成的分子机制。
3.4 碳源优化与 BC 产量提升
静态发酵实验表明,以 5% 甘油为单一碳源时,BC 产量最高达 5.89±0.38 g/L,显著高于葡萄糖等其他碳源。添加 3% 乙醇可使 BC 产量提升 5 倍,可能与乙醇促进能量代谢和 UDP - 葡萄糖合成相关。
研究首次系统解析了红曲醋生物膜的微生物组成,分离出高效产 BC 的欧洲驹形杆菌 FMES 菌株,揭示了其碳代谢和 BC 合成的分子机制,并通过碳源优化显著提升 BC 产量。该研究不仅拓展了产 BC 菌株的来源,为利用发酵食品微生物资源提供了新策略,还为 BC 在医疗伤口护理、可持续包装等领域的应用奠定了基础。未来研究可进一步探索菌株在工业规模生产中的稳定性,以及不同碳源对 BC 理化性质的影响,推动其实际应用。