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星斑川鲽新型抗菌肽Pleurocidin SF1的鉴定及其抗菌机制研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月15日 来源:Fish & Shellfish Immunology 4.1
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本研究针对水产养殖中抗生素滥用问题,从星斑川鲽(Platichthys stellatus)肝脏转录组中鉴定出新型pleurocidin基因SF1,解析其α-螺旋两亲性结构特征,证实其对革兰氏阳/阴性菌的膜破坏作用,为开发可持续抗菌替代品提供理论依据。
研究背景与意义
在水产养殖业面临抗生素耐药性挑战的当下,鱼类先天免疫系统中的抗菌肽(Antimicrobial Peptides, AMPs)因其广谱抗菌特性成为研究热点。星斑川鲽作为耐低温、抗病性强的经济鱼种,其免疫防御机制尚未充分解析。尤其值得注意的是,与冬季比目鱼同科的pleurocidin家族抗菌肽,虽在其他鱼类中被证实具有破坏微生物膜结构的能力,但在星斑川鲽中仍属空白。韩国海洋科学技术振兴院(KIMST)的研究团队通过多组学技术,首次在该物种中发现具有应用潜力的新型抗菌肽SF1。
关键技术方法
研究团队利用NCBI SRA数据库中的星斑川鲽幼虫肝脏转录组数据(SRR17701617),通过Omicsbox 3.1进行de novo组装和BLAST比对鉴定SF1基因。采用qRT-PCR检测组织分布和LPS诱导表达,SWISS-MODEL预测α-螺旋结构,并通过扫描电镜(SEM)观察细菌膜损伤。实验样本来自韩国丽水市Marine Seed养殖场提供的健康成鱼。
研究结果
1. Discovery of pleurocidin SF1 gene in starry flounder
通过转录组分析发现SF1基因编码68个氨基酸的前体肽,经蛋白水解加工后产生22个氨基酸的成熟肽,其基因结构(4外显子+3内含子)与冬季比目鱼pleurocidin高度保守。
2. Sequence analysis of pleurocidin in starry flounder
系统发育分析显示SF1成熟肽与鲽形目鱼类pleurocidin聚为一支,具有典型的两亲性α-螺旋结构,带正电荷的极性残基与疏水残基分别位于螺旋两侧。
3. Discussion
SF1在鳃、脾、肾等免疫器官中高表达,LPS刺激后表达量显著提升(p<0.05)。其对溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)和金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的最小抑菌浓度(MIC)分别为4μM和8μM,SEM显示细菌表面出现孔洞和内容物泄漏。
结论与展望
该研究首次阐明星斑川鲽pleurocidin SF1通过膜破坏机制发挥抗菌功能,其低温适应性特征(最适活性温度15-20℃)特别适合冷水养殖应用。研究成果发表于《Fish 》期刊,为开发基于鱼类天然免疫分子的新型抗菌剂提供了分子模板,同时推动星斑川鲽作为替代养殖品种的产业化进程。值得注意的是,SF1对哺乳动物红细胞溶血率<5%的低毒性特征,进一步拓展了其在跨物种医疗应用中的可能性。
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