黄秋葵黑叶霉病病原菌 Pseudocercospora abelmoschi 全基因组测序及注释研究：解析致病机制与基因组资源

为探究黄秋葵黑叶霉病病原菌致病机制，研究人员对 Pseudocercospora abelmoschi isolate Cer 86?18（MCC:9491）开展全基因组测序。结果显示基因组大小 31.90 Mb，GC 含量 54.26%，含 11,325 个蛋白编码基因等。该研究为抗病育种等提供重要资源。

　　

Pseudocercospora abelmoschi 可引起黄秋葵叶片黑霉病，该病害在雨季过后高湿温暖环境下流行，适宜条件下会导致严重落叶并显著降低产量。鉴于该病原菌的农业重要性，研究选取 P. abelmoschi 分离株 Cer 86?18（MCC:9491）进行基因组测序。基因组组装结果显示其大小为 31.90 Mb，总 GC 含量为 54.26%。通过 BUSCO（Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs）进行的定量基因组评估鉴定出 1,664 个（97.53%）完整 BUSCO，反映出保守基因的高代表性，且重复最少、直系同源独特性强。基因预测分析确定了 11,325 个蛋白质编码基因，其中 3,857 个通过 KEGG 数据库进行了注释。分析显示，410 个基因预测编码碳水化合物活性酶（CAZymes），369 个基因预测编码肽酶。还鉴定出 18 个参与次级代谢物生物合成的基因簇。通过计算机模拟流程预测共有 143 种蛋白质为效应子。这是关于 P. abelmoschi 基因组组织的首次报道。本研究旨在填补这一空白，增进对 P. abelmoschi 基因组组织和基因注释的理解，从而为功能基因组学研究铺平道路，例如鉴定毒力基因以辅助抗性育种。此外，该基因组可成为 Pseudocercospora 属现有基因组资源的又一补充，并能为宿主 - 病原体相互作用和进化关系提供有价值的见解。