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为探究生食贻贝的微生物风险，研究人员对意大利坎帕尼亚地区零售贻贝（Mytilus galloprovincialis，n=60）中肠道病毒（HuNoV、RV、HAstV 等）、呼吸道病毒及抗生素抗性基因（ARGs）进行检测。发现多种病毒高流行且存在潜在传染性，ARGs 在总菌和噬菌体组分中均有检出，为贝类食品安全监控提供科学依据。
海鲜作为餐桌上的常见美食，其安全性一直备受关注。尤其是在意大利某些地区，生食贻贝的饮食习惯使得微生物污染风险成为焦点。当前，传统的贝类安全评估主要依赖细菌指标（如大肠杆菌），但这类指标难以准确反映病毒污染情况。此外，抗生素抗性基因（ARGs）在食品供应链中的传播及其与噬菌体的关联，也成为公共卫生领域的新兴挑战。在此背景下，意大利那不勒斯费德里科二世大学（University of Naples Federico II）与西班牙农业化学和食品技术研究所（IATA-CSIC）等机构的研究人员合作，开展了一项针对贻贝中病毒污染和 ARGs 存在的综合性研究，相关成果发表在《Food and Environmental Virology》。
研究团队从意大利坎帕尼亚地区零售市场采集了 60 批次地中海贻贝（Mytilus galloprovincialis），样本主要来自坎帕尼亚（38 批次）、拉齐奥（18 批次）和普利亚（4 批次）。研究采用了病毒浓缩与核酸提取、RT-qPCR 检测、衣壳完整性分析（PMAxx-RT-qPCR）以及 ARGs 定量等技术。
病毒污染现状与粪便污染指标分析
通过 RT-qPCR 检测发现，人类诺如病毒（HuNoV）I 型（GI，77%）和 II 型（GII，40%）、轮状病毒（RV，60%）、星状病毒（HAstV，25%）在样本中普遍存在，平均病毒载量分别为 4.34、5.09、5.05 和 4.00 Log 基因组拷贝（GC）/g。甲型肝炎病毒（HAV）和戊型肝炎病毒（HEV）均未检出。粪便污染病毒指标体细胞噬菌体（88%，3.62 Log PFU/100 g）和 crAssphage（50%，3.72 Log GC/g）与 HuNoV GII、HAstV 和 RV 浓度呈强正相关（ρ>0.65，p<0.05），表明其可作为病毒污染的有效指示物。
病毒感染性评估
对 8 份多病毒阳性样本进行衣壳完整性检测（PMAxx-RT-qPCR），结果显示，热处理灭活样本的 PCR 信号显著降低（平均减少 2.02±0.95 Log GC/g），而未经处理的原始样本中仍存在完整衣壳病毒，提示这些病毒具有潜在感染性。
抗生素抗性基因分布
在高体细胞噬菌体样本中，检测到 β- 内酰胺类（blaCTX-M）、喹诺酮类（qnrB）和氯霉素类（cat1）抗性基因，总菌组分中的浓度分别为 4.63±0.04、4.43±0.14 和 4.08±0.16 Log GC/g，噬菌体组分中则为 3.51±0.16、3.92±0.03 和 2.63±0.25 Log GC/g，表明噬菌体可能参与 ARGs 的水平传播。
研究结论与讨论
本研究首次系统评估了意大利南部贻贝的病毒感染性和 ARGs 风险。结果表明，尽管现行法规依赖大肠杆菌进行贝类安全分级，但病毒污染和 ARGs 传播风险被严重低估。衣壳完整性检测证实了潜在感染性病毒的存在，而 ARGs 在噬菌体中的检出则提示需关注其在环境中的持久性和传播潜力。研究强调，传统的净化处理可能无法有效去除病毒和 ARGs，需将新型病毒指标（如 crAssphage）和噬菌体 ARGs 监测纳入现有食品安全框架。此外，意大利部分地区生食贻贝的习惯加剧了感染风险，呼吁加强对贝类生产全链条的病毒和抗性基因监测，以保障公众健康。
该研究不仅揭示了贻贝作为 “环境哨兵” 在病毒和 ARGs 传播中的作用，也为全球贝类食品安全标准的更新提供了重要数据支持，尤其在微生物风险评估方法和新型污染物监控方面具有借鉴意义。
