印度阿萨姆邦 G 基因型腮腺炎病毒全基因组研究:变异特征与疫苗效力解析

【字体: 时间:2025年05月16日 来源:Indian Journal of Microbiology 2.1

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  为探究腮腺炎病毒(MuV)基因型 G 基因组变异对疫苗效力的影响,研究人员对印度阿萨姆邦 2016-2017 年的 2 株 MuV 分离株进行全基因组测序(WGS),发现其核蛋白、HN 蛋白等存在独特变异,提示抗原性演变可能影响疫苗效果,需持续监测。

  
腮腺炎由副黏病毒科腮腺炎病毒(MuV)引起,其基因组为 15,384 个核苷酸的 RNA。尽管有疫苗保护,腮腺炎疫情仍持续发生,尤其在实行选择性疫苗政策的地区如印度。本研究旨在解析印度阿萨姆邦 MuV 基因型 G 全基因组的遗传变异,这对评估疫苗效力及制定应对病原体进化的策略至关重要。研究对 2016 年和 2017 年的 2 份样本进行全基因组测序(WGS),以世界卫生组织(WHO)参考基因组(基因型 G)进行注释,并与疫苗株(Jeryl Lynn 和 L Zagreb)及其他印度 MuV 基因型 G 全基因组序列对比。开展了系统发育分析、N - 糖基化位点测定和表位保守性分析,利用 3D 模型评估结构变异。阿萨姆 MuV 毒株(G1 和 G2)的基因组长度分别为 15,305 bp 和 15,377 bp。测序显示,多个编码基因存在独特遗传变异,尤其是核蛋白(N)、磷蛋白(P)、基质蛋白(M)和融合蛋白(F),其中包含阿萨姆序列特有的替换,提示涉及抗原位点。血凝素 - 神经氨酸酶(HN)蛋白分析显示,279 和 287 位氨基酸替换可能形成疫苗逃逸突变株。结构评估表明,整体二级构象无显著改变,但 B 细胞表位区的 N323K 替换值得关注,可能引发免疫逃逸。研究发现的遗传变异表明,MuV 基因型 G 的抗原性正在演变,可能影响疫苗效力。持续的基因组监测和免疫学研究对优化疫苗策略及应对不断进化的病原体至关重要。

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