骨骼肌纤维中肌球蛋白 mantATP 周转的实验与计算联合分析

【字体: 时间:2025年05月16日 来源:Proceedings of the National Academy of Sciences 9.4

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  本文聚焦肌球蛋白(Myosin)静息态调控肌肉收缩及基础代谢的机制,针对 mantATP 追踪技术在评估超松弛态(SRX)等时的可靠性争议,结合实验与计算机模拟,剖析信号组成,验证分析方法,为相关研究提供关键方法学参考。

  
肌球蛋白(Myosin)是骨骼肌中负责将 ATP 能量转化为机械功的主要运动蛋白。在静息状态下,肌球蛋白存在两种 ATP 周转速率不同的生化状态:超松弛态(Super Relaxed State, SRX)和无序松弛态(Disordered Relaxed State, DRX)。SRX 与抑制性复合体的结构特征 —— 相互作用头基基序(Interacting Heads Motif, IHM)紧密相关,而 DRX 的构象则更为模糊。mantATP 追踪实验是鉴定这些生化状态的常用方法,其原理是通过荧光 ATP 类似物 mantATP 的水解和释放动力学来反映肌球蛋白的状态。

然而,该技术的可靠性近年来受到质疑,尤其是在可溶性肌球蛋白制备中。为此,研究以保留天然粗丝结构和肌球蛋白协同性的去膜纤维为模型,结合实验数据和计算机模拟,解析 mantATP 追踪信号中不同成分的贡献。研究发现,去膜纤维中的非特异性 mantATP 结合信号(Nonspecific Signal, NSP)约占初始荧光发射的 60%,其动力学与 DRX 的时间尺度部分重叠,可能导致快循环肌球蛋白群体的高估。

通过蒙特卡洛模拟不同分子内和分子间协同性假设对 mantATP 水解的影响,发现即使在热力学平衡状态下,肌球蛋白头部的协同作用也可产生多指数荧光衰减。其中,分子内协同性(如同一二聚体中受阻头和自由头的状态相互影响)和分子间协同性(如相邻二聚体间的状态相互作用)均会显著改变荧光衰减的时间常数和群体分布。

进一步通过 “幽灵纤维”(Myosin 被提取的纤维)实验和质谱分析证实,非特异性信号主要来源于游离核苷酸和与结构蛋白、其他 ATP 酶(如肌浆网钙 ATP 酶 SERCA)的结合。结合反应 - 扩散模型,研究比较了双指数、三指数拟合及结合非特异性信号校正的三种数据分析方法,发现三指数拟合结合独立测定的 NSP 可更可靠地估算 SRX 和 DRX 的群体及时间常数,尤其在 SRX 群体较高时优势显著。

最后,通过哌啶碱(Piperine)诱导 SRX 失稳的实验验证,发现校正 NSP 后的分析方法能更准确地反映静息态 ATP 消耗速率,解决了追踪参数与 ATP 酶速率之间的矛盾。该研究为正确开展 mantATP 追踪实验及可靠分析结果提供了方法学指导,有助于深入理解肌球蛋白静息态的能量代谢机制,在药物开发和临床评估等领域具有重要意义。

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