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为探究长链非编码 RNA（lncRNAs）在结核分枝杆菌（Mtb）感染中的作用，研究人员分析 GSE162729 RNA 测序数据，对 H37Rv、H37Ra 和 BCG 感染的 THP1 巨噬细胞 lncRNA 特征进行研究，鉴定出 6202 个 lncRNAs，揭示其多样调控作用，为相关研究提供新方向。
越来越多的证据表明，长链非编码 RNA（long non-coding RNAs, lncRNAs）在结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis, Mtb）感染期间的转录组失调中具有潜在作用。了解 lncRNAs 的调控功能可进一步深入认识 Mtb 与宿主之间的相互作用。本研究旨在利用公开的 GSE162729 RNA 测序数据集，探索 Mtb（H37Rv、H37Ra 和 BCG 菌株）感染 THP1 巨噬细胞中的 lncRNA 特征。分析鉴定出 6202 个假定的 lncRNAs，其中大部分为新发现的 lncRNAs，表明它们在 Mtb 感染的巨噬细胞中具有重要参与。研究还发现了每个感染组中特异性诱导的若干差异表达 lncRNA 基因。对 lncRNAs 的顺式靶基因进行 Reactome 富集通路分析显示，与 H37Ra 和 BCG 感染相比，炎症免疫反应是 H37Rv 感染期间诱导的 lncRNAs 的主要特征。A 类受体清除和炎症小体（inflammasomes）也是 Mtb 和 BCG 感染组之间共同富集的术语。此外，研究强调了几个潜在的 lncRNAs 作为 Mtb 感染 THP-1 细胞中差异表达 lncRNAs 与 miRNAs 预测调控网络中的枢纽基因。这些发现表明，lncRNAs 在巨噬细胞对不同分枝杆菌菌株感染的反应中可能具有多样化的调控作用。在考虑 Mtb 菌株遗传背景的情况下，进一步研究 lncRNA 基因在 Mtb 感染中的功能将是未来研究的一个有前景的方向。
