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为明确日本海俄罗斯沿岸野生刺参(A. japonicus)肠道菌群组成,研究人员通过高通量测序开展研究。发现菌群主要由变形菌门(38.33–57.22%)等构成,区域和生境影响菌群结构,且存在 32 个共有菌属,其中 9 属为优势菌,该发现为宿主健康研究提供依据。
通过高通量测序分析日本海俄罗斯沿岸野生日本刺参(Apostichopus japonicus)肠道细菌群落的分类组成。结果显示,细菌群落主要由变形菌门(Proteobacteria,38.33–57.22%)、放线菌门(Actinobacteriota,24.24–29.93%)、厚壁菌门(Firmicutes,12.01–25.12%)和拟杆菌门(Bacteroidota,1.6–2.17%)组成,共占研究样本的 94.5%。区域和栖息地对刺参肠道微生物组的细菌结构有显著影响,每个研究水体中的无脊椎动物都有其独特的共生微生物群。然而,在所有水体的动物中发现了 32 个细菌属,其中 9 个细菌属为样本中的优势类群:斯坦普菌属(Stappia,15.89–34.68%)、寡养单胞菌属(Stenotrophomonas,3.45–11.44%)、芽孢杆菌属(Bacillus,1.05–7.71%)、葡萄球菌属(Staphylococcus,4.64–11.76%)、红球菌属(Rhodococcus,3.07–11.08%)、棒状杆菌属(Corynebacterium,2.55–7.77%)、皮肤杆菌属(Cutibacterium,15.89–34.68%)、假单胞菌属(Pseudomonas,1.2–1.7%)和链球菌属(Streptococcus,1.09–1.57%)。所有样本中共有细菌属的发现表明,可能存在对宿主健康和功能至关重要的核心微生物组。