LRP2 作为线粒体代谢相关基因的表达与结肠癌预后的相互作用:整合多组学分析

【字体: 时间:2025年05月17日 来源:Discover Oncology 2.8

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  为探究结肠癌(COAD)预后标志物及治疗靶点,研究人员基于 TCGA、GEO 等多组学数据,分析 1234 个线粒体代谢相关基因(MMRGs),发现 LRP2 高表达与 COAD 不良预后、临床病理分期正相关,且促进细胞增殖,为 COAD 诊疗提供新方向。

  
结肠癌是全球第三大常见癌症,近年来在 50 岁以下人群中发病率不断上升,且发生转移的患者 5 年生存率不足 20%。如何精准识别预后标志物、开发有效治疗靶点成为亟待解决的临床难题。线粒体作为细胞代谢的核心枢纽,其代谢通路异常与肿瘤的发生发展密切相关,但针对线粒体代谢相关基因(MMRGs)在结肠癌中的系统性研究却较为匮乏。

为填补这一研究空白,天津医科大学肿瘤医院的研究人员开展了一项整合多组学的研究,旨在挖掘与结肠癌预后相关的关键基因。该研究成果发表在《Discover Oncology》,为结肠癌的诊疗提供了重要的理论依据。

研究人员首先从 The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库获取结肠癌(COAD)患者的 mRNA 测序数据及临床信息,结合 Gene Expression Omnibus(GEO)数据库的单细胞测序和转录组数据,通过差异表达分析、共识聚类、单因素及多因素 Cox 回归分析等方法,从 1234 个 MMRGs 中筛选出关键基因 LRP2。研究采用的主要技术方法包括:利用 TCGA 和 GEO 数据库进行多组学数据分析;通过免疫组化(IHC)染色检测患者组织中 LRP2 的表达;运用细胞计数试剂盒 - 8(CCK-8)和流式细胞术验证 LRP2 对结肠癌细胞增殖能力的影响;借助基因集富集分析(GSEA)探索 LRP2 相关信号通路;在 CellMiner 数据库中分析 LRP2 与药物敏感性的关联。

关键研究结果


1. LRP2 表达与结肠癌预后的相关性


基于 TCGA 和 GEO 数据库分析发现,LRP2 高表达与结肠癌患者不良预后显著相关(P<0.05),且其表达水平与临床病理分期呈正相关(P<0.05)。单细胞测序数据显示,LRP2 在特定细胞类型中富集,并与增殖相关通路密切关联。

2. LRP2 与基因突变及肿瘤微环境的关系


突变分析表明,LRP2 高表达组的肿瘤突变负荷(TMB)显著高于低表达组,且 TMB 高的患者预后更差(P<0.05)。进一步研究发现,LRP2 在 Wnt、PI3K-Akt、MAPK 等多个肿瘤增殖相关通路中显著富集,提示其通过调控这些通路促进肿瘤进展。

3. LRP2 对结肠癌细胞增殖的影响


细胞实验显示,在 HCT116 和 SW480 结肠癌细胞系中过表达 LRP2,可显著增强细胞的增殖能力,CCK-8 和流式细胞术检测结果均证实了这一结论(P<0.05)。

4. LRP2 的临床转化价值


免疫组化染色结果显示,LRP2 在不同结肠癌患者组织中的表达存在异质性,且高表达患者的生存率显著低于低表达患者(P=0.014)。药物敏感性分析表明,LRP2 高表达与 Tipifarnib、Vemurafenib 等多种抗癌药物的敏感性正相关,为个体化治疗提供了潜在方向。

研究结论与意义


本研究通过多组学整合分析,系统揭示了 LRP2 作为线粒体代谢相关基因在结肠癌中的关键作用:其高表达与患者预后不良、病理分期进展、基因突变负荷增加及细胞增殖能力增强密切相关,且参与调控多条肿瘤增殖信号通路。这些发现不仅为结肠癌的预后评估提供了新的生物标志物,也为靶向 LRP2 的治疗策略奠定了理论基础。未来进一步探索 LRP2 在肿瘤微环境中的具体作用机制,有望开发出更具针对性的结肠癌治疗方案,为改善患者预后带来新希望。

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