沉默 hnRNPD 通过增强 TXNIP 介导的氧化应激抑制胃癌生长

【字体: 时间:2025年05月18日 来源:Discover Oncology 2.8

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  胃癌治疗面临预后不佳的挑战,RNA 结合蛋白(RBPs)在肿瘤中作用关键。研究人员聚焦异质性核核糖核蛋白 D(hnRNPD),分析其在胃癌中的表达及功能。发现 hnRNPD 高表达与不良预后相关,敲低 hnRNPD 可通过 TXNIP 增强氧化应激抑制肿瘤生长,为胃癌治疗提供新靶点。

  
胃癌是全球最常见且致命的恶性肿瘤之一,其发病机制复杂,涉及幽门螺杆菌感染、不良饮食习惯等多种因素。尽管当前治疗手段包括手术、化疗、免疫治疗和靶向分子治疗,但胃癌患者的预后仍不理想。因此,阐明驱动胃肿瘤发生和进展的分子机制至关重要。RNA 结合蛋白(RBPs)在基因表达的转录后调控中起着关键作用,通过控制 RNA 加工和运输,包括调节 RNA 剪接、多聚腺苷酸化、mRNA 稳定性、定位和翻译,对维持细胞转录组至关重要。越来越多的研究表明,RBPs 在多种癌症组织中异常表达,并影响许多与癌症相关的细胞表型,同时也是一系列抗癌疗法的潜在靶点。近年来,探索 RBPs 与胃癌之间的关系备受关注。异质性核核糖核蛋白(hnRNPs)是 RBPs 的一个大家族,通过与 RNA 分子相互作用,调节 RNA 从合成到降解的代谢过程。hnRNP 家族包括约 20 个主要成员,从 hnRNPA1 到 hnRNPU。多项研究表明,hnRNPs 与恶性肿瘤密切相关,但 hnRNPD 作为 hnRNP 家族成员,其在胃癌中的具体作用和潜在机制尚未明确。为解决这一问题,湖北医药学院附属随州医院等机构的研究人员开展了相关研究,旨在揭示 hnRNPD 在胃癌中的作用及机制,该研究成果发表在《Discover Oncology》。

研究人员主要采用了以下关键技术方法:利用公共数据库(如 TCGA、CCLE、Kaplan–Meier Plotter)进行生物信息学分析;通过免疫组织化学技术检测 hnRNPD 在胃癌组织微阵列(包含 80 例胃癌组织和 80 例配对癌旁正常胃黏膜组织)中的表达;运用细胞培养和转染技术,使用短发夹 RNA(shRNA)质粒和小干扰 RNA(siRNA)分别敲低 hnRNPD 和 TXNIP 的表达;通过实时定量 PCR(RT-qPCR)和蛋白质印迹法检测基因和蛋白表达水平;借助 CCK-8 和集落形成实验评估细胞增殖和克隆形成能力;采用 RNA 测序(RNA-seq)和 RNA 免疫沉淀测序(RIP-seq)技术筛选 hnRNPD 的靶基因;利用 RIP-qPCR 验证 hnRNPD 与靶基因 mRNA 的结合;通过 RNA 衰变实验检测 mRNA 稳定性;使用流式细胞术和试剂盒检测细胞内活性氧(ROS)、丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)水平以评估氧化应激状态。

3.1 hnRNPD 在胃癌中上调表达且其升高预示预后不良


通过 TCGA 数据库分析发现,hnRNPD 在包括胃癌在内的多种癌症中表达升高。ROC 诊断曲线显示,hnRNPD 的表达可有效区分胃癌与正常组织。Kaplan–Meier Plotter 在线数据库分析表明,hnRNPD 表达与总生存率和疾病特异性生存率呈负相关。组织微阵列分析也显示,hnRNPD 在胃癌中高表达,且其过表达与不良预后相关,提示 hnRNPD 可能作为胃癌的潜在生物标志物。

3.2 hnRNPD 缺失抑制胃癌细胞生长


CCLE 数据库显示,hnRNPD 在胃癌细胞系中频繁表达,其中 AGS 和 HGC-27 细胞中表达最高。通过 shRNA 介导的敲低实验,在 AGS 和 HGC-27 细胞中耗尽 hnRNPD 后,CCK-8 和集落形成实验表明,沉默 hnRNPD 抑制了细胞的增殖和克隆形成能力,提示 hnRNPD 可能促进胃癌的发生。

3.3 hnRNPD 缺失增加细胞氧化应激


对 hnRNPD 敲低后的 AGS 细胞进行 RNA-seq 分析,差异表达基因(DEGs)显著富集于氧化应激相关的 GO 术语。进一步检测氧化应激指标发现,敲低 hnRNPD 可刺激 AGS 和 HGC-27 细胞中 ROS 和 MDA(氧化应激生物标志物)的生成,同时降低 SOD 和 GSH-Px(抗氧化酶)的活性,表明 hnRNPD 对胃癌细胞生长的影响与氧化应激的调节有关。

3.4 hnRNPD 直接与 TXNIP 相互作用并负向调节其 mRNA 表达


RIP-seq 结合 RNA-seq 数据,筛选出 70 个候选基因,其中 TXNIP 在胃癌中下调,且与 hnRNPD 表达呈负相关。RT-qPCR 显示,hnRNPD 敲低导致 AGS 和 HGC-27 细胞中 TXNIP mRNA 表达增加。RIP-PCR 证实 hnRNPD 富集于 TXNIP mRNA,RNA 衰变实验表明 hnRNPD 沉默延长了 TXNIP mRNA 的半衰期,说明 hnRNPD 通过影响 TXNIP mRNA 的稳定性来调控其表达。

3.5 hnRNPD 通过 TXNIP 介导的氧化应激发挥致癌作用


在 hnRNPD 敲低的 AGS 和 HGC-27 细胞中沉默 TXNIP,发现 hnRNPD 敲低引起的氧化应激减轻,同时细胞增殖的减少得以逆转,表明 hnRNPD 的促肿瘤特性部分依赖于 TXNIP 介导的氧化应激。

结论与讨论


本研究发现,RNA 结合蛋白 hnRNPD 在胃癌组织中过表达,并促进胃癌细胞生长。机制上,hnRNPD 与 TXNIP 结合并负向调节其 mRNA 表达,从而保护细胞免受氧化应激。靶向 hnRNPD 可能为胃癌提供一种有前景的治疗策略。该研究首次揭示了 hnRNPD 在胃癌中的作用及与氧化应激的关联,为胃癌的诊断和治疗提供了新的靶点和理论依据,有助于推动针对 hnRNPD 的抗癌疗法的开发。

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