综述:组学技术在糖尿病伤口愈合中的作用:单细胞 RNA 测序、批量 RNA 测序、空间转录组学和蛋白质组学应用的最新见解

【字体: 时间:2025年05月18日 来源:Advances in Therapy 3.4

编辑推荐:

  本综述聚焦糖尿病足溃疡(DFUs)这一严重并发症,探讨高通量组学技术(蛋白质组学、批量 RNA 测序(bulk RNA-seq)、单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)、空间转录组学)在其病理机制解析、治疗靶点发现及新型疗法作用机制阐释中的应用与最新进展。

  糖尿病足溃疡(DFUs)是糖尿病(DM)的严重并发症,每年影响全球数百万人,具有高致残率、高死亡率及沉重经济负担。当前治疗手段成本高且疗效有限,亟需新型高效疗法。近年来,高通量组学技术在 DFUs 研究中取得显著进展,为深入理解其分子机制及开发靶向治疗提供了新方向。

组学技术在糖尿病伤口愈合中的应用概述


  • 技术类型与研究价值:蛋白质组学、批量 RNA 测序(bulk RNA-seq)、单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)及空间转录组学等组学技术,通过分析基因、蛋白质表达谱及细胞空间分布,揭示 DFUs 病理过程中免疫细胞(如巨噬细胞)、结构细胞(如成纤维细胞)的功能变化,鉴定关键分子靶点及信号通路,同时为新型伤口敷料和细胞疗法的作用机制提供分子层面证据。

批量 RNA 测序与单细胞 RNA 测序的研究进展


  • 炎症期:巨噬细胞的表型转换(M1 促炎型向 M2 抗炎型)对伤口愈合至关重要。scRNA-seq 发现 DFU 愈合患者中存在独特的 “愈合相关成纤维细胞” 亚群,高表达 MMP1、MMP3、HIF1α 等基因,与基质降解和炎症调控相关;而非愈合患者中 M2 巨噬细胞比例更高,伴随抗炎基因 CHI3L1表达增加。此外,CD8+T 细胞和 B 细胞在非愈合溃疡中减少,IL-17 信号通路与溃疡形成相关。
  • 增殖与血管生成期:内皮细胞功能异常是 DFUs 血管生成障碍的关键。scRNA-seq 显示,非愈合 DFUs 中内皮细胞的 CCND1、ENO1、MMP2等促血管生成基因表达下调,而 RAB17 基因通过调控 MAPK/ERK 信号通路影响血管生成,其过表达可改善糖尿病伤口愈合。巨噬细胞通过分泌 VEGF、IGFBP2等因子促进组织再生,其功能异常(如高糖环境下 M1 活化不足)可导致愈合延迟。
  • 细胞外基质(ECM)重塑期:ECM 重塑依赖成纤维细胞和巨噬细胞的协同作用。批量 RNA-seq 发现,愈合患者中 MMP2表达上调,促进胶原降解和重塑;非愈合患者则存在 CYP1A 等与皮肤屏障功能相关基因的高表达,提示 ECM 代谢失衡。SLCO2A1基因在血管内皮细胞中的抑制与伤口愈合加速相关,可能成为新的治疗靶点。

空间转录组学的应用


空间转录组学通过保留组织空间结构信息,揭示细胞间相互作用对伤口愈合的影响。研究发现,DFU 愈合患者伤口床中 M1 巨噬细胞和 “愈合相关成纤维细胞” 富集,且 MMP1、HIF1α 等基因呈空间特异性表达;而非愈合患者中 M2 巨噬细胞分布更广泛,提示炎症微环境的空间异质性是愈合差异的重要原因。该技术为解析复杂组织修复过程提供了直观的分子空间图谱。

蛋白质组学的研究成果


  • 生物标志物发现:血清蛋白质组学筛选出 IL-4、IL-6、IFN-γ 等与 DFU 愈合相关的蛋白标志物,其中 IL-10 可作为预测愈合的单一标志物;APOA1在愈合患者中表达上调,参与凝血、炎症及血管生成过程,其水平与 DFU 严重程度负相关。
  • 治疗靶点与机制解析:蛋白质组学证实 MMP9在 DFUs 中过度表达,其抑制剂(R)-ND-336 在动物模型中显示出优于传统药物的疗效;脂肪干细胞(ADSCs)通过上调 GAPDH、KRT1等蛋白,促进免疫调节和表皮再生,其分泌组的蛋白质组分析为细胞疗法的优化提供了依据。此外,β- 谷甾醇通过激活 MAPK、mTOR 和 VEGF 通路,促进 M2 巨噬细胞极化和胶原合成,展现出潜在治疗价值。

总结与展望


组学技术通过多维度解析 DFUs 的分子病理网络,揭示了巨噬细胞、成纤维细胞及内皮细胞等在不同愈合阶段的关键作用,鉴定了 MMPs、HIF1α、RAB17 等潜在治疗靶点,并为新型生物材料和细胞疗法的机制阐释提供了科学依据。未来,整合多组学数据与人工智能分析,有望加速个性化治疗方案的开发,推动 DFUs 诊疗从 “经验性” 向 “精准化” 转型。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号