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为探究 m6A（N?- 甲基腺苷）修饰与 lncRNA（长链非编码 RNA）在胶质瘤中的作用，研究人员对不同级别胶质瘤进行全转录组 m6A 分析。发现 LGG 中 m6A 丰度高于 GB，且 m6A 谱可区分肿瘤亚型，为胶质瘤研究提供新方向。
在生命科学与医学领域，肿瘤的发生发展机制一直是研究的热点与难点。作为中枢神经系统常见的恶性肿瘤，胶质瘤因其高侵袭性和复杂的分子特征，严重威胁人类健康。其中，胶质母细胞瘤（GB）是恶性程度最高的 IV 级胶质瘤，患者预后极差，中位生存期仅 8-9 个月，而低级别胶质瘤（LGG）虽恶性程度较低，但部分病例会进展为高级别肿瘤。近年来，RNA 修饰作为表观转录组学的重要组成部分，在肿瘤中的作用备受关注。m6A（N?- 甲基腺苷）作为真核生物中最常见的 RNA 修饰之一，参与调控 RNA 的代谢过程，如剪接、稳定性、翻译等。然而，目前关于 m6A 修饰与长链非编码 RNA（lncRNA）在胶质瘤中的相互作用及临床意义的研究仍不充分，尤其是在临床样本中针对 lncRNA 的 m6A 修饰分析较为匮乏。
为填补这一研究空白，立陶宛卫生科学大学（Lithuanian University of Health Sciences）的研究人员开展了一项针对胶质瘤中 m6A-lncRNA 景观的深入研究。该研究成果发表在《Molecular Medicine》上，为揭示胶质瘤的分子机制和潜在治疗靶点提供了重要依据。
研究人员收集了 17 例胶质母细胞瘤（GB）和 9 例低级别胶质瘤（LGG）的肿瘤组织样本，运用直接 RNA 长读长测序（DRNA-seq）技术，在单 m6A 位点分辨率下分析了不同级别胶质瘤中 lncRNA 的全转录组 m6A 修饰情况。
m6A 表观转录组景观分析
通过对 26 例胶质瘤样本的分析，研究人员发现 m6A 修饰主要集中在 mRNA 转录本中（98.5%），而 lncRNA 中的 m6A 修饰仅占 1.16%。值得注意的是，LGG 中 lncRNA 的 m6A 修饰丰度（23.73%）显著高于 GB（15.84%），表明 m6A 修饰水平可能与肿瘤恶性程度相关。
lncRNA 的 m6A 谱聚类分析
无监督聚类分析显示，根据 lncRNA 的 m6A 谱可将胶质瘤分为两个簇（C1 和 C2）。GB 主要聚集在 C1 簇，而 LGG 则分散在 C1 和 C2 簇中。临床特征关联分析表明，m6A 簇与较高的 Ki-67 增殖指数（p=0.04）和肿瘤位置（p<0.01）显著相关。特别是位于小脑的肿瘤，其 lncRNA 的 m6A 修饰水平显著高于其他脑区的肿瘤。
生存分析与基因表达关联
生存分析显示，lncRNA 的 m6A 修饰状态在 GB 和 LGG 队列中对术后生存时间无显著预测价值。多数 lncRNA 在 m6A 甲基化组中表达较高，其中 MIR9-1HG（r=0.439，p=0.028）和 ZFAS1（r=0.609，p<0.05）的 m6A 修饰与表达呈显著正相关。此外，研究发现胶质瘤中 m6A 写入酶和擦除酶的 mRNA 水平并不反映整体 m6A 甲基化水平。
差异甲基化 lncRNA 的鉴定
研究鉴定出 10 个在胶质瘤中差异甲基化的 lncRNA，如 GAS5、MIR9-1HG、CHASERR 等，这些 lncRNA 可能在胶质瘤细胞中发挥调控作用。例如，ZFAS1 的 m6A 修饰与 RNA 水平升高相关，其在 GB 中的低甲基化可能与肿瘤进展有关。
该研究首次系统揭示了胶质瘤中 lncRNA 的 m6A 修饰景观，发现 m6A 修饰水平与肿瘤恶性程度、增殖指数及肿瘤位置相关，并鉴定出差异甲基化的 lncRNA。研究结果表明，m6A-lncRNA 轴在胶质瘤中受到强烈调控，形成生物学上不同的亚群，为胶质瘤的分子分型和潜在治疗靶点提供了新方向。尽管存在样本量较小、未涉及非聚腺苷酸化转录本等局限性，但该研究为进一步深入研究 m6A-lncRNA 在胶质瘤中的作用奠定了基础，有望推动基于表观转录组学的胶质瘤精准医疗发展。
