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为解决吗啡长期使用的严重副作用问题,研究人员对阿尔及利亚贝贾亚海岸海洋沉积物中的细菌展开研究,通过代谢谱和分子建模,发现 A58365A 等化合物与 μ- 阿片受体(5C1M)结合稳定,为开发安全阿片类药物提供新方向。
阿片类药物如吗啡虽广泛用于中重度疼痛治疗,但其长期使用会导致呼吸抑制、便秘等严重副作用,甚至引发死亡案例。因此,寻找兼具镇痛效果与更高安全性的替代药物成为全球医学研究的紧迫课题。海洋环境因蕴含丰富多样的微生物及其代谢产物,逐渐成为新型药物开发的重要来源。阿尔及利亚贝贾亚海岸拥有独特的地中海生态系统,其海洋沉积物中可能存在尚未被发掘的微生物资源,有望从中筛选出具有 opioid 样活性的化合物。
在此背景下,来自阿尔及利亚贝贾亚大学等机构的研究团队,针对该海岸沉积物中的可培养细菌展开研究,旨在发现能够靶向 μ- 阿片受体的新型生物活性物质。相关研究成果发表于《Scientific Reports》,为阿片类药物的安全性改进提供了新的科学依据。
研究人员主要采用了以下关键技术方法:
- 微生物分离与鉴定:从贝贾亚西海岸 4 个位点采集海洋沉积物样本,通过 6 种培养基分离出 45 株细菌,利用 16S rRNA 基因测序结合多相分类法,将其中 18 株抗菌活性菌株鉴定为链霉菌属、诺卡氏菌属等 6 个属,其中菌株 S5T2H1 被初步认定为链霉菌属新物种。
- 代谢产物分析:运用高分辨质谱(LC-HRESIMS)对选定菌株的次生代谢产物进行分析,鉴定出 A58365A、 antimycin A、cyclo (phenylalanyl-prolyl) 等已知化合物及多种未知代谢物。
- 分子模拟研究:通过分子对接(Glide XP 模式)、分子动力学模拟(Desmond 软件)及 MM/GBSA 结合能计算,评估化合物与 μ- 阿片受体(PDB 编号 5C1M)的相互作用稳定性及结合强度。
研究结果
1. 海洋沉积物理化性质与细菌多样性
沉积物 pH 呈碱性(7.78–8.13),盐度和有机质含量因位点而异。SCA 培养基分离效果最佳,共获得 24 株细菌。18 株抗菌活性菌株分属 6 个属,其中链霉菌属和诺卡氏菌属为优势菌,首次在阿尔及利亚海域发现假诺卡氏菌属、中华微菌属等,显示该区域微生物多样性丰富。
2. 抗菌活性筛选与代谢产物鉴定
菌株 S5T2H1 对革兰氏阳性菌(如金黄色葡萄球菌、MRSA)及部分革兰氏阴性菌表现出最强抑菌活性,抑菌圈可达 35 mm。代谢产物分析显示,S56T3J31 菌株产生 A58365A 和 antimycin A,S5T2H1 合成 cyclo (phenylalanyl-prolyl) 和 niphimycin Ia,S7T2H1 分泌 berberifuranol,其中部分化合物为首次在微生物中发现。
3. 分子模拟与受体结合研究
分子对接结果显示,A58365A 对接得分 - 5.84 kcal/mol,虽略低于吗啡(-7.04 kcal/mol),但其通过水介导氢键、疏水作用等与受体关键残基(如 Asp147、Lys233)形成稳定相互作用。分子动力学模拟表明,A58365A-5C1M 复合物的均方根偏差(RMSD)波动小于吗啡复合物,显示更高的结构稳定性。MM/GBSA 计算进一步证实其结合自由能(-46.66 kcal/mol)与吗啡接近,提示二者作用机制相似。
结论与讨论
本研究通过对阿尔及利亚贝贾亚海岸海洋细菌的系统分析,成功筛选出多个具有 μ- 阿片受体结合潜力的化合物,其中 A58365A 展现出与吗啡相当的结合稳定性,为开发低副作用的新型镇痛药物提供了潜在候选分子。研究结果不仅拓展了海洋微生物在药物开发中的应用前景,也为解决传统阿片类药物的安全性问题提供了新方向。未来需进一步通过体外和体内实验验证这些化合物的镇痛活性及毒性,推动其向临床应用转化。
该研究首次揭示了阿尔及利亚海域微生物资源在阿片类药物替代研究中的价值,强调了海洋生物多样性在应对人类健康挑战中的重要意义,为后续海洋天然药物的深入开发奠定了基础。