HIV-1 包膜蛋白开放过程中融合肽构象轨迹研究:解析病毒入侵机制与中和抗体作用靶点

【字体: 时间:2025年05月18日 来源:Nature Communications 14.7

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  HIV-1 包膜糖蛋白(Env)构象变化是病毒入侵关键。为明确融合肽(FP)从抗体可及到不可及状态的机制,研究人员利用 SOSIP 稳定 Env 外结构域,结合冷冻电镜(cryo-EM)等技术,发现 CD4 诱导 Env 开放初期 FP 仍可结合抗体,随开放程度增加 FP 逐步埋藏。该研究揭示 HIV-1 入侵关键中间态,为疫苗开发提供新方向。

  
艾滋病(AIDS)的病原体人类免疫缺陷病毒 1 型(HIV-1)的入侵机制一直是全球科研的焦点。HIV-1 通过其表面的包膜糖蛋白复合体(Env)与宿主细胞受体结合,引发一系列构象变化实现膜融合。其中,位于 gp41 亚基 N 端的疏水融合肽(Fusion Peptide, FP)是病毒入侵的关键组件,其构象动态变化与抗体识别密切相关。然而,在受体结合后,FP 如何从抗体可及状态转变为不可及状态的具体机制尚未明确,这极大限制了针对该靶点的疫苗和药物开发。

为解决这一关键科学问题,美国杜克大学(Duke University)等机构的研究人员开展了深入研究。他们以 SOSIP 稳定的 Env 外结构域为模型,结合多种高分辨率结构生物学和生物物理技术,系统解析了 HIV-1 Env 在 CD4 受体诱导下的构象转变轨迹,特别是 FP 的动态变化过程。研究成果发表在国际权威期刊《Nature Communications》上,为揭示 HIV-1 入侵机制和中和抗体设计提供了重要线索。

研究团队主要采用了以下关键技术方法:

  1. 冷冻电镜(cryo-EM):对 CD4 和抗体结合的 Env 复合体进行单颗粒冷冻电镜分析,捕获不同时间点的构象中间体。
  2. 表面等离子体共振(SPR):实时监测 FP 暴露程度和 Env 开放状态的动态变化。
  3. 单分子荧光共振能量转移(smFRET):在病毒颗粒表面原位追踪 Env 构象变化,验证中间体的生理相关性。

研究结果


1. CD4 诱导 Env 开放后 FP 仍存在抗体可及状态


通过 SPR 实验发现,尽管 CD4 诱导 Env 发生显著开放,FP 靶向抗体 VRC34.01 仍可结合 Env,且与共受体模拟抗体 17b 联用时结合效率下降。冷冻电镜分析鉴定出三种颗粒群体(Population 1-3),其中 Population 1 为部分开放中间体,三个原聚体均结合 CD4、17b 和 VRC34.01,表明 FP 在 Env 开放初期仍保持抗体可及性。随时间延长,Population 2 和 3 中未结合抗体的 FP 位点逐渐增多,提示 FP 埋藏与 gp120 亚基位移程度相关。

2. 功能性部分开放中间体的结构特征


Population 1 结构显示,gp120 亚基呈现 CD4 诱导的典型构象特征(如桥接片层和 α0 螺旋形成),但 gp41 亚基构象扰动较小,FP 通过与 VRC34.01 结合维持暴露状态。与已发表的部分开放结构(如 PDB: 6CM3)对比发现,FP 的可及性或埋藏状态取决于 FP 近端区域(FPPR)的构象变化:VRC34.01 稳定 FP 暴露构象,而 8ANC195 抗体则促进 FP 埋藏。

3. FP 埋藏的分子机制与下游构象重排


在 Population 2 和 3 中,未结合抗体的 FP 位点均埋藏于 gp120/gp41 疏水口袋中。结构分析表明,gp120 亚基沿垂直于三聚体轴的方向进一步旋转,伴随 gp41 的 HR1 和 HR2 区域重排,导致 FPPR 螺旋伸直、口袋扩大,最终使 FP 稳定埋藏。smFRET 实验显示,VRC34.01 可稳定 Env 处于部分开放中间体状态,而 CD4 与 17b 联用则推动 Env 向完全开放状态转变。

4. 早期构象中间体的捕获与验证


通过排除共受体模拟抗体 17b,捕获到更早的构象群体(Population 4 和 5)。这些中间体显示 gp120 亚基分步旋转,先发生 V1V2 环帽结构破坏,再逐步形成桥接片层和 α0 螺旋,证实 CD4 诱导的 Env 开放是一个不对称、多步骤的过程。

结论与讨论


本研究首次系统揭示了 HIV-1 Env 从闭合状态到 CD4 结合对称开放状态的分步构象轨迹,明确 FP 在受体结合后仍可短暂保持抗体可及性,其埋藏需要 gp120 亚基的进一步旋转和 gp41 的协同重排。这些发现填补了 HIV-1 入侵机制中的关键空白,特别是 FP 动态变化的中间态特征,为理解中和抗体的作用窗口期提供了结构基础。

研究还发现,FP 的 “可及 - 埋藏” 转换与 Env 开放程度密切相关,这解释了为何部分中和抗体(如 VRC34.01)能靶向早期中间体,而疫苗设计需关注 FP 在不同构象状态下的抗原表位呈现。此外,HIV-1 FP 在预受体状态下的暴露可能是病毒为平衡 Env 稳定性与融合能力的进化策略,这为开发模拟天然构象的疫苗免疫原提供了新思路。

该研究整合多种先进技术,从分子层面解析了病毒 - 宿主相互作用的动态过程,不仅深化了对 HIV-1 入侵机制的理解,也为抗艾药物和疫苗的研发提供了关键靶点和理论依据,具有重要的科学意义和临床转化价值。

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