综述:冠状病毒移码元件:结构、功能及作为治疗靶点的潜力

【字体: 时间:2025年05月18日 来源:TRENDS IN Pharmacological Sciences 13.9

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  本综述聚焦冠状病毒移码元件(FSE),其由滑动七核苷酸序列及下游 RNA 结构(如假结或茎环)组成,通过程序性 - 1 核糖体移码(-1 PRF)调控病毒复制。文中探讨其结构功能、靶向药物开发现状与挑战,为抗病毒策略提供参考。

  

冠状病毒移码元件的结构、功能及靶向治疗潜力


移码元件(frameshifting element, FSE)是冠状病毒复制机制中的关键组分,其核心结构由一段滑动七核苷酸序列(slippery heptanucleotide sequence)与下游 RNA 结构(如下游假结结构 pseudoknot 或茎环结构 stem-loop)共同组成。这一特殊结构广泛存在于多种 RNA 病毒中,通过调控程序性 - 1 核糖体移码(programmed -1 ribosomal frameshifting, -1 PRF)过程,实现对病毒复制效率的精准调控,使其成为极具潜力的广谱抗病毒靶点。

FSE 的结构特征与动态多样性


FSE 的结构呈现高度保守性与动态可塑性的双重特性。保守性体现在其核心组成 —— 滑动七核苷酸序列通常为 “UUUAAAC” 及其类似变体,下游 RNA 结构则以假结为主(如茎环 - 假结复合结构),这种保守架构是 - 1 PRF 发生的必要前提。而动态可塑性表现为 FSE 在不同病毒株及宿主环境中可形成多种构象异构体,例如在 SARS-CoV-2 中,FSE 的假结结构存在 “开放” 与 “闭合” 两种互变状态,其构象平衡直接影响核糖体移码效率。近年来,随着冷冻电镜(cryo-EM)、核磁共振(NMR)等 RNA 结构解析技术的突破,研究者得以捕捉到 FSE 在核糖体结合前后的构象动态变化,揭示了其通过构象切换调控 - 1 PRF 的分子机制。

FSE 在病毒复制中的核心功能


-1 PRF 是 FSE 发挥功能的核心机制,其过程可分为三个关键阶段:首先,核糖体在滑动七核苷酸序列处发生短暂停滞,导致 tRNA 错配;随后,核糖体向前移动一个核苷酸位置(-1 位),使读码框发生改变;最后,下游 RNA 结构(如假结)通过与核糖体相互作用稳定移码状态,确保病毒多聚蛋白的正确翻译。在冠状病毒中,-1 PRF 的效率通常维持在 5%-25%,这一精确调控对病毒复制至关重要:移码效率过高会导致结构蛋白表达不足,过低则影响复制酶复合体的生成。SARS-CoV-2 的研究表明,FSE 介导的 - 1 PRF 直接影响病毒基因组 RNA 与亚基因组 RNA 的比例,进而调控病毒的转录 - 复制平衡。

FSE 作为抗病毒靶点的研究进展


针对 FSE 的药物开发主要通过虚拟筛选(如分子对接、分子动力学模拟)与表型筛选(如基于报告基因的 - 1 PRF 活性检测)两大策略展开。目前已发现多种潜在抑制剂,例如:

  1. 小分子化合物:如氨基糖苷类抗生素(如庆大霉素)可通过结合核糖体 A 位点,干扰 FSE 与核糖体的相互作用,抑制 - 1 PRF;
  2. 核酸适配体:靶向 FSE 假结结构的适配体(如 AS1411 类似物)可通过空间位阻阻碍核糖体移位;
  3. 天然产物:绿茶提取物表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)被证实可通过稳定 FSE 的非活性构象降低移码效率。

然而,现有抑制剂普遍面临三大挑战:一是靶向特异性不足,因 FSE 结构与宿主细胞内某些 RNA 元件存在相似性,易引发脱靶效应;二是细胞通透性差,多数核酸类抑制剂难以有效穿透细胞膜;三是病毒耐药性风险,FSE 序列的高突变率可能导致药物结合位点快速变异。

未来研究方向与挑战


尽管 FSE 靶向治疗展现出广阔前景,但其临床转化仍需突破以下瓶颈:

  1. 构效关系精细化研究:借助单分子荧光共振能量转移(smFRET)等技术,实时追踪 FSE 构象动态与药物结合的相互作用,建立更精准的结构 - 功能 - 活性模型;
  2. 新型递送系统开发:如脂质纳米颗粒(LNP)或病毒样颗粒(VLP)包裹核酸类药物,提高靶向递送效率并降低毒性;
  3. 联合用药策略:将 FSE 抑制剂与现有抗病毒药物(如核苷类似物、蛋白酶抑制剂)联用,通过多靶点协同作用降低耐药风险;
  4. 跨病毒保守性靶点挖掘:分析不同冠状病毒(如 SARS-CoV、MERS-CoV、SARS-CoV-2)FSE 的保守结构域,开发具有广谱活性的候选药物。

结语


FSE 作为冠状病毒复制的 “分子开关”,其结构与功能的深入解析为抗病毒药物研发提供了全新视角。尽管当前靶向 FSE 的药物开发仍面临诸多挑战,但其在广谱抗病毒治疗中的潜力不容忽视。随着结构生物学、药物化学与系统生物学的交叉融合,未来有望通过创新技术手段突破瓶颈,将 FSE 从理论靶点转化为临床可用的治疗工具,为应对新发突发 RNA 病毒感染提供关键策略。

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