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本文聚焦碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)感染难题,探究抗菌肽 Cec4 的抗菌机制。发现其低浓度下具快速杀菌、抑制生物膜等作用,能破坏细胞膜、结合核酸,体内实验证实其疗效,为 CRKP 感染治疗提供新方向。
研究背景与 CRKP 感染现状
抗生素滥用导致抗菌药物耐药性成为公共卫生难题,CRKP 作为 ESKAPE 病原体之一,对碳青霉烯类抗生素广泛耐药(耐药率 46%-66%),且对替加环素耐药率上升,黏菌素虽为常用药但 50% 患者用药后可能出现急性肾损伤,亟需新型抗生素。抗菌肽(AMPs)因独特作用机制、对人体无害及不易使细菌产生耐药性等特点,成为新一代抗生素的潜在选择。自 1980 年首次发现天蚕素以来,已有超 3000 种源自昆虫、植物和哺乳动物等的抗菌肽被研究。前期研究表明,Cec4 对革兰氏阴性菌有强效作用,对多重耐药和广泛耐药肺炎克雷伯菌的最低抑菌浓度(MIC)为 4-8 μg/mL,且高浓度(100×MIC)对人红细胞无溶血性,但对 CRKP 的作用尚不明确。
材料与方法
- 菌株与培养条件:使用肺炎克雷伯菌标准菌株 NCTC9633(购自 ATCC)及从贵州某三级医院分离的 CRKP 菌株,在 37°C 的 LB 培养基中过夜培养。
- 肽合成:Cec4 抗菌肽(序列:GWLKKIGKKIERVGQNTRDATIQAIGVAQQAANVAATLKGK)以三氟乙酸(TFA)盐形式合成,纯度>95%,TFA 残留量<0.5%,溶于双蒸水配制成 10 mg/mL 溶液,通过在线软件 HeliQuest 分析疏水性,利用 I-TASSER 预测三维空间结构。
- 体外抗菌活性检测:采用微量肉汤稀释法测定 MIC,进行耐药性发展研究、时间依赖性杀菌实验、棋盘法检测与传统抗生素的协同效应,利用结晶紫法评估对生物膜的抑制和清除能力。
- 抗菌机制研究:通过分子动力学模拟、扫描和透射电子显微镜观察、脂多糖和磷脂抑制实验、外膜通透性检测、膜电位和膜流动性测定、活性氧(ROS)检测及 DNA 和 RNA 凝胶阻滞实验等,探究 Cec4 的抗菌机制。
- 体内疗效评估:构建 BALB/c 小鼠皮肤伤口感染模型,分为空白组(PBS 处理)和 Cec4 治疗组(10 mg/kg Cec4 溶液),观察伤口愈合情况,进行细菌计数和组织学分析。
- 转录组分析:对经 Cec4(8 μg/mL)或 PBS 处理 1.5 h 的肺炎克雷伯菌进行 RNA 提取、文库构建和测序,筛选差异表达基因并进行 GO 和 KEGG 富集分析,通过 qRT-PCR 验证 RNA-Seq 结果。
结果
- Cec4 的结构特征:Cec4 具有均匀的极性和非极性氨基酸分布,平均疏水性 0.088,平均疏水矩 0.594,预测形成两亲性结构,二级结构含 68.29%α- 螺旋和 19.51% 无规卷曲,具典型阳离子、两亲性和 α- 螺旋特性。
- 体外抗菌活性:Cec4 对肺炎克雷伯菌标准菌株 ATCC13883、48 株临床分离 CRKP 菌株和 2 株临床分离多粘菌素耐药肺炎克雷伯菌的 MIC 分别为 4 μg/mL、4-8 μg/mL 和 8 μg/mL。连续 20 代亚致死浓度(0.5×MIC)处理后,肺炎克雷伯菌的 MIC 波动 1-2 倍,提示长期使用不易诱导细菌耐药。杀菌动力学显示,Cec4 在 30 min 内即可杀菌,且呈剂量依赖性。与利福平、万古霉素联合时,部分抑菌浓度指数(FICI)≤0.5,显示协同或相加效应;与左氧氟沙星等联合时 FICI>1,无协同作用。Cec4 在 2 μg/mL(0.5×MIC)及以上浓度可显著抑制生物膜形成,对成熟生物膜也有显著清除作用。
- 抗菌机制:扫描和透射电子显微镜显示,Cec4 处理后细菌膜结构破坏,出现穿孔、皱缩、塌陷和溶解。分子动力学模拟表明,Cec4 与细菌膜磷脂双层相互作用,主要通过带正电的氨基酸残基与带负电的脂质膜静电结合。NPN 和 PI 染色显示,Cec4 以浓度依赖性方式增加外膜和全膜通透性。DiSC3 (5) 和 Laurdan 检测表明,Cec4 使膜电位去极化,膜流动性降低。DCFH-DA 检测显示,Cec4 诱导 ROS 产生,且 ROS 清除剂 NAC 可显著削弱 Cec4 的抗菌活性,提示 ROS 在杀菌中起关键作用。DNA 和 RNA 凝胶阻滞实验证实,Cec4 可结合细菌 DNA 和 RNA。
- 体内疗效:在小鼠皮肤伤口感染模型中,Cec4 治疗组伤口面积在第 7 天和第 11 天分别减少至 57.70% 和 21.39%,显著小于 PBS 组(73.34% 和 36.10%),细菌计数显著降低,组织学分析显示 Cec4 促进表皮再生和真皮恢复,胶原纤维更致密有序。
- 转录组分析:共筛选出 966 个差异表达基因,其中 955 个上调,11 个下调。GO 富集显示差异基因与生物膜、细胞膜、氧化应激等相关;KEGG 富集到 11 条通路,涉及细菌分泌系统、转运系统等。qRT-PCR 验证了部分差异基因的表达变化。
讨论与结论
CRKP 感染率和死亡率高,现有治疗药物有限且存在诸多不足。Cec4 作为一种 α- 螺旋抗菌肽,对 CRKP 具显著抑制作用,具快速杀菌、抗生物膜、不易诱导耐药等优势。其抗菌机制主要包括破坏细胞膜完整性、诱导 ROS 积累、结合核酸等。体内实验证实其能有效抑制 CRKP 感染,促进伤口愈合。转录组分析揭示其通过影响膜蛋白、氧化应激相关基因及核酸合成等发挥作用。本研究为 CRKP 感染的临床治疗提供了新候选药物和理论依据,但 Cec4 在糖尿病等特殊人群伤口愈合中的作用仍需进一步研究。