《Microbial Ecology》：Testing for Consistency in Co-occurrence Patterns Among Bacterial Taxa Across the Microbiomes of Four Different Trematode Parasites
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为探究宿主身份对微生物共现模式的影响，研究人员以同一生境中感染同一蜗牛的四种吸虫为对象，分析其微生物共现模式。发现模式因吸虫种类而异，揭示宿主生态生理特征对微生物群落组装的重要性。
在微生物与宿主互作的神秘世界里，解析宿主微生物群落组装的驱动机制始终是生命科学领域的核心谜题之一。目前，尽管学界普遍认识到宿主身份可能影响微生物共现模式，但多数研究未能有效控制环境变量，难以明确宿主特异性特征与微生物互作网络的真实关联。例如，不同宿主的生理差异、资源利用策略或免疫应答是否会导致微生物间协同或拮抗关系的显著分化，仍是悬而未决的科学问题。在此背景下，来自新西兰奥塔哥大学（University of Otago）的研究团队聚焦于吸虫 - 蜗牛宿主系统，开展了一项极具创新性的研究，相关成果发表于《Microbial Ecology》。
该研究旨在检验当外部环境高度可控时，不同宿主物种内微生物共现模式是否存在显著差异。研究人员选取了四种系统发育、生态和生理特征均不同的吸虫物种 —— 奥特波半肠吸虫（Galactosomum otepotiense）、 attenuatus 眼吸虫（Philophthalmus attenuatus）、棘缘吸虫（Acanthoparyphium sp.）和新西兰滨海吸虫（Maritrema novaezealandense），它们均以同一泥螺物种（Zeacumantus subacarinatus）作为第一中间宿主，且采样于同一时间和地点。这种独特的研究系统为排除环境干扰、聚焦宿主特异性因素提供了理想模型。
研究采用了一系列关键技术方法：首先通过 16S rRNA 基因 V4 区测序（引物 515F-806R）对四种吸虫的微生物组进行高通量测序，利用 QIIME 2 平台结合 DADA2 插件进行序列去噪和物种注释，并通过严格的过滤流程排除污染（如线粒体、叶绿体序列及负对照中的非特异性序列）。随后，针对在至少 20% 宿主个体中出现的 8 个细菌科（包括伯克霍尔德菌科 Burkholderiaceae、丛毛单胞菌科 Comamonadaceae 等），运用 Spearman 秩相关分析检测种内微生物丰度相关性，并通过跨物种相关性比较评估共现模式的一致性。
结果分析
微生物组成与共现模式的种间差异
通过相对丰度分析发现，8 个细菌科在四种吸虫中的分布呈现显著异质性。在棘缘吸虫（Acanthoparyphium sp.）和 attenuatus 眼吸虫（Philophthalmus attenuatus）中，分别检测到 4 个及以上显著或边缘显著的微生物对相关性（如 Hymenobacteraceae 与 Rhodobacteraceae 的正相关），而在奥特波半肠吸虫（Galactosomum otepotiense）和新西兰滨海吸虫（Maritrema novaezealandense）中则未发现显著相关性，仅存在少数边缘效应。这表明部分吸虫宿主内存在特定的微生物互作网络，而其他宿主内的微生物关联则相对随机。
跨物种共现模式的不一致性
对六种吸虫两两组合的相关性系数进行 Spearman 分析，结果显示所有组合均未呈现显著的正相关或负相关关系。例如，某细菌科对在一种吸虫中的强正相关，在另一种吸虫中可能表现为弱相关或无相关。这一结果直接证明，微生物共现模式具有高度的宿主物种特异性，缺乏跨宿主的普遍一致性。
讨论与意义
研究结论表明，即使在相同环境中共享同一中间宿主，不同吸虫物种的微生物共现模式仍存在显著差异，暗示宿主的生态生理特征（如摄食模式、体型大小、免疫应答）可能通过塑造局部微环境（如营养资源分布、免疫选择压力）影响微生物互作。例如，棘缘吸虫较大的体型可能为微生物提供更复杂的微生境，促进特异性共现网络的形成；而营被动吸收营养的新西兰滨海吸虫，其微生物组成可能更依赖随机过程。此外，研究还提出垂直传播时序、宿主发育阶段等因素可能通过 “优先效应（priority effects）” 间接调控群落组装。
这项研究突破了传统微生物组关联研究的局限性，首次在严格控制环境变量的条件下，证明宿主身份本身可作为驱动微生物共现模式分化的关键因子。其科学意义不仅在于揭示了寄生虫 - 微生物互作的复杂性，更为理解宿主特异性微生物群落的功能进化提供了新视角。未来研究可进一步结合实验生态学方法，解析微生物互作的分子机制（如代谢物交换、竞争排斥），并拓展至更广泛的宿主 - 微生物系统，为靶向调控微生物组以干预宿主健康（如寄生虫病防治）奠定理论基础。
