Graves 病枢纽基因与关键通路的生物信息学分析及验证:探索新型生物标志物的潜在价值
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时间:2025年05月20日
来源:Hormones 2.4
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为提升 Graves 病(GD)诊断水平与患者预后,研究人员分析甲状腺组织样本 mRNA 谱,经批量校正和差异分析,筛选出 8 个枢纽基因(如 TYROBP、CSF1R 等),富集于免疫相关通路,RT-qPCR 验证其在 GD 中上调,为 GD 诊疗提供新方向。
本研究旨在识别与 Graves 病(GD)发生及进展相关的枢纽基因,以开发新型生物标志物改善诊断和患者预后。研究人员从 GEO(GSE9340)、ArrayExpress(E-MEXP-2612)和 GTEx(甲状腺数据集)获取甲状腺组织样本(24 例 GD vs. 24 例正常对照)的 mRNA 谱,通过 SVA 算法进行批次校正后,利用 limma 鉴定出 366 个差异表达基因(DEGs)。随后进行功能富集、蛋白质 - 蛋白质相互作用网络和免疫微环境分析,并通过 RT-qPCR 在临床甲状腺标本(3 例 GD vs. 3 例对照)中验证枢纽基因。结果显示,患病组与正常组共鉴定出 366 个 DEGs,其中 8 个枢纽基因(TYROBP、CSF1R、CD163、ITGAM、CD86、FCGR3B、ITGB2 和 IL10RA)与免疫细胞含量密切相关。这些基因主要富集于氨基酸代谢、病毒蛋白与细胞因子及细胞因子受体相互作用、吞噬体、趋化因子信号、程序性细胞死亡、NF-κB 等通路,且与 39 个调节因子相关。RT-qPCR 验证临床样本中这些枢纽基因的 mRNA 水平,值得注意的是,8 个基因在 GD 样本中均呈上调表达。结论表明,ITGB2、TYROBP、CSF1R、CD163、ITGAM、CD86、FCGR3B 和 IL10RA 对 GD 的发生发展具有潜在影响,支持其作为潜在生物标志物的作用。
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