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结直肠癌(CRC)侵袭性亚型治疗选择有限。本研究聚焦 USP7 与 DACH1,探究其在 CRC 中的作用。发现 USP7 通过去泛素化稳定 DACH1,GCN5 介导的 DACH1 K680 乙酰化增强其与 USP7 互作。临床表明两者高表达预示预后差,靶向 USP7-DACH1 轴或成新策略。
论文解读
研究背景
结直肠癌(colorectal cancer, CRC)是全球癌症相关死亡的主要原因之一,其侵袭性亚型的治疗选择极为有限。肿瘤的发生发展与蛋白质的翻译后修饰密切相关,其中泛素化和去泛素化过程通过调控蛋白稳定性与功能,在肿瘤生长和转移中扮演关键角色。泛素化通常标记蛋白使其被蛋白酶体降解,而去泛素化酶(deubiquitinase, DUBs)则通过去除泛素链稳定蛋白。DACH1(dachshund homolog 1)作为一种染色质结合蛋白,在不同癌症中表现出双重作用:在肾癌、肺癌等中起抑癌作用,但在 CRC 中却被发现可能促进肿瘤进展,其机制尚不明确。去泛素化酶 USP7(ubiquitin-specific protease 7,又称 HAUSP)已被证实通过稳定关键蛋白促进多种癌症的进展,但在 CRC 中的具体功能及与 DACH1 的关联仍需深入探究。此外,乙酰化修饰作为另一种重要的翻译后修饰,可能与去泛素化协同调控蛋白功能,但其在 DACH1 稳定性调控中的作用尚未见报道。因此,揭示 CRC 中 DACH1 和 USP7 的作用机制,寻找新的治疗靶点,对改善患者预后具有重要意义。
为解决上述问题,中国科学技术大学第一附属医院的研究人员开展了相关研究,旨在阐明 USP7 和 DACH1 在 CRC 中的作用及调控机制,研究成果发表在《Cell Death and Disease》。
主要技术方法
研究采用了质粒转染、慢病毒感染构建稳定细胞系,通过免疫共沉淀(Co-IP)、免疫荧光(IF)验证蛋白互作,利用免疫组织化学(IHC)分析临床样本中蛋白表达,借助体内外泛素化实验、蛋白质印迹(WB)检测蛋白稳定性与修饰,构建裸鼠皮下移植瘤及肺转移模型评估肿瘤生长与转移能力,并运用统计学方法分析临床数据与实验结果的相关性。样本队列包括 180 例人类 CRC 组织芯片及 56 对新鲜 CRC 肿瘤与癌旁组织。
研究结果
DACH1 蛋白高表达与 CRC 恶性进展及不良预后相关
通过分析 TCGA 数据库及临床样本,发现 CRC 肿瘤组织中 DACH1 mRNA 水平虽高于正常组织,但与患者预后无显著关联;而 DACH1 蛋白在 CRC 组织中显著上调,且与肿瘤 T、N 分期及病理分期呈正相关,高表达患者总体生存率更低。进一步研究表明,DACH1 蛋白水平与 mRNA 水平无明显相关性,提示其表达主要受翻译后调控。
USP7 与 DACH1 直接互作并稳定 DACH1 蛋白
质谱分析及免疫共沉淀实验证实,USP7 与 DACH1 在 CRC 细胞中直接结合,两者主要共定位于细胞核。结构域分析显示,USP7 的 TRAF 样结构域与 DACH1 的 DACHbox-C 结构域是互作的关键区域。功能实验表明,USP7 过表达可显著提高 DACH1 蛋白水平,延长其半衰期,而 USP7 敲低或抑制则导致 DACH1 降解加速,且该过程依赖 USP7 的去泛素化酶活性。
USP7 通过去除 DACH1 的 K48 位泛素链拮抗 UHRF1 介导的降解
泛素化实验发现,USP7 敲低可增加 DACH1 的泛素化水平,而 USP7 过表达则减少其泛素化,尤以 K48-linked 泛素链为甚。进一步鉴定出 E3 泛素连接酶 UHRF1 可直接结合 DACH1 并促进其 K48 位泛素化及蛋白酶体降解,而 USP7 通过去泛素化作用拮抗 UHRF1 的效应,稳定 DACH1 蛋白。
GCN5 介导的 DACH1 K680 乙酰化增强其与 USP7 的互作
乙酰化实验证实,DACH1 可被乙酰化修饰,抑制去乙酰化酶可增强其乙酰化水平。通过数据库分析及突变实验,确定 K680 为 DACH1 的关键乙酰化位点,乙酰转移酶 GCN5(general control nonderepressible 5)负责该位点的乙酰化。GCN5 过表达可增强 DACH1 与 USP7 的互作,而 K680 突变则削弱两者结合,提示乙酰化通过促进蛋白互作增强 DACH1 稳定性。
USP7 与 DACH1 表达正相关,联合预测 CRC 不良预后
临床样本分析显示,USP7 与 DACH1 蛋白水平呈显著正相关,两者高表达患者的总体生存率显著低于低表达者,提示两者联合可作为 CRC 预后不良的生物标志物。
研究结论与意义
本研究揭示了 CRC 中 USP7 通过去泛素化稳定 DACH1、GCN5 介导的乙酰化增强两者互作的双重调控机制,阐明了 DACH1 在 CRC 中作为癌蛋白的作用机制,并证实 USP7-DACH1 轴与肿瘤恶性进展及不良预后密切相关。该研究不仅拓展了对 CRC 发病机制的认识,还为靶向治疗提供了新方向,如开发 USP7 抑制剂或调控 DACH1 乙酰化状态的药物,有望为侵袭性 CRC 患者带来新的治疗选择。此外,研究强调了翻译后修饰在肿瘤调控中的复杂性,为深入理解肿瘤异质性及开发多靶点治疗策略提供了理论依据。