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为确保稿件结论的数据支撑强度与质量、数据解读合理性,本刊要求作者在同行评审前提交冷冻电镜(cryo-EM)和断层扫描(cryo-ET)的结构数据(地图和模型)。此举助力严格同行评审,推动领域数据共享共识发展。
在生命科学研究领域,数据作为支撑论文结论的基石,其质量与可靠性至关重要。尤其对于《Nature Structural & Molecular Biology》(NSMB)所评审和发表的众多涉及结构分析的稿件而言,如何确保结构数据的严谨性成为同行评审的关键问题。过去,尽管《自然》系列期刊对 DNA 序列、RNA 序列等数据类型有明确的共享要求,但结构数据如冷冻电镜(cryo-EM)和断层扫描(cryo-ET)实验得出的地图和模型,在发表前却无法让审稿人获取,这在一定程度上影响了同行评审的严格性和数据的可重复性。随着冷冻电镜技术的普及和应用12范围的扩大,让审稿人在评审前能够评估最终的三维重建和原子模型,成为提升研究质量的必然需求。
为解决这一问题,NS3MB 的研究人员开展了关于结构数据在同行评审前共享的研究。该研究旨在推动结构数据在审稿阶段的透明化,以加强数据审核,提升稿件质量。研究得出,要求作者在稿件送交1全面外部评审前,向编辑和审稿人提供结构数据(包括冷冻电镜和断层扫描实验的地图和模型),有助于审稿人评估数据的可靠性和模型的有效性,符合领域内日益增长的数据共享共识。该研究成果发表在《Natur14e Structural & Molecular Biology》上,为结构生物学领域的同行评审机制提供了新的思路和实践指导。
作者开展研究主要用到的关键技术方法包括冷冻电镜(cryo-EM)和断层扫描(cryo-ET)技术,用于获取结构数据;同时涉及 wwPDB 验证报告的使用,以评估原子模型的可靠性。此外,研究中要求作者使用标准3表格报告冷冻电镜、核磁共振(NMR)和 X 射线晶体学的数据收集和处理统计数据,以促进研究的可重复性和数据的再利用。
研究结果方面,首先明3确了结构数据在同行评审前共享的必要性。通过要求作者在审稿前提交冷冻电镜和断层扫描的地图与模型,结合 wwPDB 验证报告,审稿人能够更全面地考察模型的可靠性和验证指标,确保数据支撑结论的强度。其次,研究提出了具体的操作流3程。当使用冷冻电镜的新研究投稿时,编辑会全面阅读稿件并决定是否送审,此时要求作者将相关文件上传至稿件跟踪系统或利用投稿系统中的 figshare,为审稿人提供数据的保密访问权限,发表后作者可删除上传数据以避免与公共存储库的数据冗余。
研究结论表明,NSM5B 要求作者在同行评审前共享结构数据(尤其是冷冻电镜和断层扫描的地图和模型),是提升同行评审严谨性的重要举措,与领域内数据共享的共识相契合。讨论部分强调,这一实践不仅有4助于确保稿件数据的质量和可靠性,推动研究的可重复性,还能促进结构生物学领域的健康发展,为其他期刊在结构数据评审方面提供借鉴。通过加强数据共享和严格的同行评审,有望进一步提升生命科学研究的整体水平,为相关领域的突破奠定坚实基础。16