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罗马尼亚Candidozyma auris菌株的临床与分子特征分析(2022-2023):抗真菌耐药传播与基因组进化研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月20日 来源:Microbiology Spectrum 3.7
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这篇综述系统分析了罗马尼亚首次报告的102例Candidozyma auris(原Candida auris,C. auris)感染病例,揭示了该病原体在ICU患者中的高传播性(68.18%死亡率)及全部分离株对氟康唑耐药、16%对两性霉素B耐药的严峻现状。通过全基因组测序(WGS)和生物信息学分析,首次证实该国存在Clade Ib分支的两次独立输入事件,并发现ERG11Y132F、FCY1S70R等耐药基因突变。研究为全球防控这一被WHO列为关键优先病原体的"超级真菌"提供了重要分子流行病学证据。
ABSTRACT
高度耐药的Candidozyma auris(原Candida auris)因其引发系统性感染的能力、抗真菌药物耐药性及院内高传播性引发全球关注。研究团队对2022-2023年罗马尼亚102例患者开展回顾性分析,通过MALDI-TOF质谱鉴定病原体,采用Micronaut系统进行药敏试验,并利用Illumina平台完成基因组测序。值得注意的是,80例患者来自ICU,57例确诊感染(含29例血流感染),所有患者均曾接受广谱抗生素治疗。
IMPORTANCE
该研究首次系统描绘了C. auris在罗马尼亚的暴发特征,揭示其基因组进化动态与耐药机制。病原体携带的ERG11Y132F突变导致对氟康唑普遍耐药,而两性霉素B耐药率(16%)与全球Clade I菌株特征相符。研究强调在无该病原体历史的地区实施主动监测的必要性。
INTRODUCTION
作为WHO四大关键优先真菌病原体之一,C. auris具有独特的热耐受性、渗透压耐受性及消毒剂抗性,能在医院环境持续存活。自2009年首次发现以来,全球已报告6个进化分支(Clade I-VI)。罗马尼亚于2022年初首次发现病例,本研究聚焦其早期传播阶段的临床与分子特征。
RESULTS
患者特征显示,65.3%为男性,平均年龄65岁,89.1%存在基础疾病(心血管疾病65.6%,糖尿病34.3%)。80例与ICU相关,98例曾接受广谱抗生素(78例使用碳青霉烯类),74例有抗真菌药物暴露史。31株测试菌株均对氟康唑耐药(MIC 32->128 μg/mL),5株对两性霉素B耐药(MIC 2-16 μg/mL),但对棘白菌素类保持敏感。
分子分析发现27个基因组均属Clade Ib,形成两个亚群:25株构成单系群(提示本地传播),另2株(Ca19/Ca20)与国际菌株聚类。所有菌株携带ERG11Y132F(唑类耐药)和FCY1S70R(5-氟胞嘧啶耐药)突变,染色体1变异最多(平均174个)。位于进化树根部的Ca26株(克卢日医院分离)变异最少,可能是罗马尼亚早期传播株。
DISCUSSION
研究验证了C. auris在医疗机构的"超级传播"特性,其耐药表型与ERG11过表达、外排泵基因(CDR1E709D、MDR1K749R)突变相关。值得注意的是,65.4%患者同时携带耐碳青霉烯肠杆菌(CRE),凸显抗菌药物管理的重要性。尽管存在筛查偏倚(66例定植vs 57例感染),68.18%的感染死亡率仍显著高于其他念珠菌血症。
MATERIALS AND METHODS
采用MALDI-TOF Biotyper(cut-off值1.7)鉴定菌株,参照CDC折点判读药敏结果。全基因组经Trimmomatic质控后,使用SPADES 3.12.067组装,通过Pathogenwatch数据库进行Clade分型。耐药基因分析涵盖ERG家族、CDR等42个靶点,Snippy工具用于变异检测。
研究局限性包括回顾性设计导致的临床数据缺失,以及B13916参考基因组注释不完整。未来需开展功能性研究验证新发现的K691E(TAC1B)、*907Y(MRR1A)等突变位点的耐药贡献。结论强调,C. auris在罗马尼亚的传播凸显了跨境病原体监测与基因组实时追踪对公共卫生应对的关键价值。
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