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为解析非洲栽培稻(O. glaberrima)耐盐机制,研究人员利用含 335 份材料的关联群体,通过 9990 个 SNP 标记开展 GWAS。基于混合线性模型鉴定到 34 个 MTAs,分布于 11 条染色体,筛选出 21 份耐盐基因型。该研究为耐盐育种提供分子标记与种质资源,助力盐渍区水稻生产。
水稻(Oryza sativaL.)和非洲栽培稻(Oryza glaberrimaSteud)是全球种植最广泛的两大稻种,使水稻成为全球产量第二的作物。尽管亚洲栽培稻(O. sativa)因高产和适销性被广泛种植,但非洲栽培稻(O. glaberrima)拥有包括耐旱、耐涝和耐盐等重要抗逆遗传特性。全基因组关联研究(Genome-wide Association Studies, GWAS)在亚洲栽培稻中应用更为广泛,但其在非洲栽培稻中对关键农艺性状生物学机制的研究仍待拓展。本研究旨在通过与耐盐性状相关的标记 - 性状关联(Marker-Trait Associations, MTAs),挖掘非洲栽培稻(O. glaberrima)中耐盐性关键基因。研究利用 Yoshida 营养液,在温室条件下对先前构建的 335 份非洲栽培稻(O. glaberrima)关联群体进行表型评估,并利用 9990 个单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)标记进行基因分型。通过 6103 个多态性 SNP 标记开展 GWAS 分析,以检测与耐盐性相关的基因组区域。基于混合线性模型方法,共鉴定到 34 个 MTAs,分布于染色体 1、3、4、5、6、7、8、9、10、11 和 12 的 11 个基因组区域(染色体 2 除外),揭示了不同显著位点对耐盐胁迫的贡献。根据标准评价系统评分,在测试材料中鉴定出 21 份耐盐至中等耐盐基因型,可作为育种项目的优质材料。本研究鉴定的 SNP 标记、基因型和基因组区域,为解析潜在耐盐基因及开发用于非洲稻耐盐筛选的功能标记提供了宝贵资源。研究强调了非洲栽培稻(O. glaberrima)作为遗传资源在提升盐渍区水稻产量中的潜力,为可持续水稻生产提供了重要支撑。