亚精胺缓解蒙古韭种子衰老作用机制的蛋白质组学和转录组学分析

【字体: 时间:2025年05月21日 来源:Scientific Reports 3.8

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  种子衰老会影响发芽率等指标,为探究亚精胺(Spd)对蒙古韭种子的作用,研究人员通过生理指标测定及蛋白、转录组测序分析。发现 Spd 可提升发芽率与抗氧化酶活性,降低 MDA、H?O?含量,揭示能量代谢是关键通路,为种子贮藏提供理论依据。

  种子作为植物繁衍的核心器官,其贮藏寿命和活力直接关系到农业生产与物种保存。然而,自然衰老过程中,种子会因活性氧(ROS)积累、膜脂过氧化、能量代谢失衡等导致发芽率下降,这一问题在野生植物如蒙古韭(Allium mongolicum)中尤为突出。蒙古韭是百合科葱属多年生草本植物,被誉为 “沙漠野菜”,具有抗氧化、抗菌等多种生理功能,但过度放牧和环境退化导致其野生种质资源锐减,而种子繁殖是其主要繁衍方式,因此延长种子贮藏寿命、提升衰老种子活力成为亟待解决的科学问题。
为破解蒙古韭种子衰老的分子机制,内蒙古农业大学的研究人员开展了一项系统性研究。团队以不同贮藏年限的蒙古韭种子为材料,结合生理指标检测、蛋白质组学和转录组学分析,探究外源亚精胺(Spd)对衰老种子的调控作用。研究发现,Spd 处理可显著提高种子发芽率、抗氧化酶(如 CAT、POD、SOD、APX)活性,降低丙二醛(MDA)和过氧化氢(H?O?)含量,缓解细胞膜损伤。进一步研究揭示,能量代谢通路(如糖酵解 / 糖异生、三羧酸循环、戊糖磷酸途径)是蒙古韭种子衰老的核心调控路径,Spd 通过激活相关基因和蛋白表达(如烯醇化酶、丙酮酸激酶、异柠檬酸脱氢酶等),恢复能量代谢平衡,从而延缓种子衰老。该研究成果发表在《Scientific Reports》,为野生植物种质资源保存和分子标记辅助育种提供了新方向。

研究主要采用以下技术方法:

  1. 生理指标测定:包括发芽率、发芽势等发芽指标,以及抗氧化酶活性、MDA 和 H?O?含量、相对电导率、呼吸速率等生理参数的检测,部分指标采用试剂盒(如南京建成生物工程研究所试剂盒)完成。
  2. 蛋白质组学分析:利用 LC-MS/MS 技术进行蛋白分离和检测,通过 DIA-NN 软件和自建数据库进行数据分析,筛选差异表达蛋白(DEPs),并进行 GO 和 KEGG 功能富集分析。
  3. 转录组学分析:使用 DESeq2 软件筛选差异表达基因(DEGs),结合 KEGG 通路分析和加权基因共表达网络分析(WGCNA),挖掘关键调控基因和模块。
  4. 细胞凋亡检测:采用 TUNEL 法检测种子细胞凋亡水平,通过荧光显微镜观察阳性细胞核比例。

研究结果


1. Spd 对蒙古韭种子发芽指标的影响


随着贮藏时间延长,种子发芽率、发芽势等指标先升后降,6 年贮藏种子发芽率仅约 40%。Spd 处理显著提升各贮藏年限种子的发芽指标,如 6 年贮藏种子发芽率从 39% 提升至 50.33%,并促进胚根伸长。这表明 Spd 可有效缓解衰老对种子萌发的抑制作用。

2. Spd 对抗氧化系统和有毒物质积累的影响


贮藏过程中,抗氧化酶活性(CAT、POD 等)先升后降,MDA 和 H?O?含量则先降后升。Spd 处理显著增强抗氧化酶活性,降低 ROS 和 MDA 含量,说明其通过激活抗氧化系统减轻膜脂过氧化损伤。

3. 能量代谢通路是种子衰老的核心路径


蛋白质组和转录组联合分析显示,差异表达蛋白和基因显著富集于能量代谢通路,如糖酵解 / 糖异生(ko00010)、三羧酸循环(TCA cycle,ko00020)、戊糖磷酸途径(ko00030)等。关键酶如己糖激酶(HK)、磷酸果糖激酶(PFK)、柠檬酸合酶(CS)在衰老种子中表达下调,而 Spd 处理可显著上调其表达,恢复能量代谢。

4. 细胞凋亡与种子衰老的关系


TUNEL 检测表明,衰老种子细胞凋亡率显著升高(6 年贮藏种子凋亡率达 50.94%),Spd 处理则显著降低凋亡率(至 6.59%),提示 Spd 可能通过抑制 ROS 诱导的程序性细胞死亡(PCD)延缓衰老。

5. 多组学联合筛选关键调控蛋白


通过蛋白 - 蛋白相互作用(PPI)网络分析,鉴定出烯醇化酶(ENO1)、丙酮酸激酶(PK)、6 - 磷酸葡萄糖酸脱氢酶(G6PDH)等 10 个与种子衰老密切相关的核心蛋白,其编码基因的表达趋势与种子活力指标高度一致。

研究结论与意义


本研究通过多组学联合分析,系统揭示了蒙古韭种子衰老的分子机制,证实能量代谢失衡是衰老的核心驱动因素,而 Spd 通过激活糖酵解、TCA 循环等通路恢复能量供应,同时增强抗氧化防御、抑制细胞凋亡,从而有效缓解种子衰老。研究首次在蒙古韭中建立了 “Spd - 能量代谢 - 抗氧化系统 - 细胞凋亡” 的调控网络,为野生植物种子贮藏提供了 “分子靶点 - 代谢通路 - 生理表型” 的完整理论框架。此外,研究筛选出的关键基因(如 ENO1、PK)和蛋白可作为种子贮藏性分子标记,为蒙古韭抗逆品种选育和种质资源长期保存奠定了基础。该研究不仅丰富了种子衰老的分子机制理论,也为农业和生态领域中濒危植物的保护提供了创新技术路径。

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