
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
野生甘蓝型油菜根际微生物多样性及稳定性的驱动机制:广适性物种与关键种的核心作用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月21日 来源:Scientific Reports 3.8
编辑推荐:
本研究针对野生甘蓝型油菜(Brassica napus)根际微生物组生态功能不明的科学问题,通过多组学技术解析了其根际与周边土壤的微生物群落差异。研究发现根际特异性富集Pseudomonas brassicacearum、Olpidium brassicae等广适性物种(generalists),并通过网络分析揭示关键种(keystone species)通过模块化连接维持群落稳定性。该成果为理解植物-微生物互作机制及转基因作物环境风险评估提供了理论依据。
在农业生态系统中,甘蓝型油菜(Brassica napus)作为重要的油料作物,其栽培品种的根际微生物组已被广泛研究。然而,脱离人工管理的野生种群如何塑造独特的根际微环境,仍是生态学领域的未解之谜。野生油菜与微生物的互作强度可能远超农田系统,这种自然状态下的生态过程对理解植物-微生物协同进化具有重要意义。
为揭示这一机制,国家生态研究所等机构的研究团队对韩国五处草地的154份根际与周边土壤样本展开多组学分析。通过16S rRNA、ITS和18S rRNA基因测序,结合结构方程模型(SEM)和SpiecEasi网络分析,首次系统阐释了野生油菜根际微生物组的组装规律。论文发表于《Scientific Reports》。
研究采用高通量扩增子测序技术(16S/ITS/18S rRNA基因)检测微生物群落,利用标准化生态位宽度指数划分广适性物种(generalists)、常见类群(common taxa)和专性物种(specialists)。通过跨物种生态网络分析识别关键种(keystone species),并运用SEM模型解析微生物多样性维持机制。
微生物群落组成与多样性差异
非度量多维标度(NMDS)分析显示,根际与周边土壤的细菌、真菌和真核微生物群落结构显著分离(PERMANOVA,p=0.001)。根际微生物多样性(Shannon指数)显著降低,但特异性富集了假单胞菌(Pseudomonas brassicacearum)、芸薹油壶菌(Olpidium brassicae)和滑行鞭毛虫(Glissomonadida)等类群。其中O. brassicae在根际真菌群落占比高达60%,但其低序列相似性(<90%)提示其非病原特性。
生态位分化与广适性物种作用
通过生态位宽度分析,鉴定出11个细菌和1个真菌(O. brassicae)为根际广适性物种。这些类群包括Massilia、Streptomyces等具有促生功能的微生物,其中6个同时存在于周边土壤广适性物种中。值得注意的是,根际广适性物种虽仅占ASV总数的5.3%,却贡献了58.6%的真菌生物量,表明植物对有益微生物的主动招募。
跨物种互作网络特征
构建的微生物网络包含2,664个节点和6,655条边,具有小世界特性(聚类系数0.065)。根际微生物75%的连接发生在内部,且关键种(22个模块枢纽和11个连接器)主要来自Chitinophagaceae、Rhizobiaceae等科。这些关键种通过模块内连接(枢纽)或跨模块连接(连接器)维持网络稳定性,但与广适性物种无直接重叠,暗示二者功能分化。
稳定性驱动机制
SEM模型(CFI=0.986)证实广适性物种直接促进微生物多样性(β=0.38,p<0.01),而关键种通过提升网络稳定性间接增强多样性。这种双路径调控机制解释
生物通微信公众号
知名企业招聘