可溶性 CD4 通过靶向内体受体结合位点抑制埃博拉病毒感染

【字体: 时间:2025年05月21日 来源:iScience 4.6

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  【编辑推荐】埃博拉病毒(EBOV)感染致死率高,其入侵机制亟待突破。本研究发现人可溶性 CD4(sCD4)及 CD4 模拟小分子(CD4mcs)可靶向 EBOV 糖蛋白(GP)的内体受体尼曼 - 匹克 C1(NPC1)结合位点,阻断病毒入侵。该成果为开发新型抗 EBOV 药物提供了关键靶点与思路。

  埃博拉病毒(EBOV)作为丝状病毒家族的代表成员,其引发的埃博拉病毒病(EVD)具有极高的致死率,严重威胁全球公共卫生安全。EBOV 的入侵机制依赖其表面糖蛋白(GP)与宿主细胞内体受体尼曼 - 匹克 C1(NPC1)的特异性结合,然而该过程的分子细节尚未完全明晰,且目前缺乏高效的靶向治疗手段。因此,揭示 EBOV 与宿主受体相互作用的关键位点,开发新型入侵抑制剂成为亟待攻克的科学难题。
来自美国内布拉斯加大学林肯分校兽医学院及生物医学科学学院、波士顿大学国家新兴传染病实验室等机构的研究团队,在《iScience》发表研究成果,首次发现人类可溶性 CD4(sCD4)及其模拟小分子化合物(CD4mcs)能够有效抑制 EBOV 感染,并深入解析了其作用机制。

研究人员主要采用了以下关键技术方法:通过假病毒中和实验和真实病毒感染实验(在 BSL-4 级生物安全实验室进行)验证抑制活性;利用生物层干涉 ometry(BLI)技术检测蛋白与小分子的结合亲和力及动力学;通过流式细胞术和细胞表面结合竞争实验确认靶点相互作用;运用分子对接(HDOCK 和 AutoDock Vina 程序)分析结构结合模式。

可溶性 CD4 及衍生蛋白抑制 EBOV 感染


研究发现,人 sCD4 的四域蛋白(4D-CD4)和二域蛋白(2D-CD4)均能抑制假型 EBOV 感染,其中 4D-CD4 的半数抑制浓度(IC??)为 2.76 μM,活性优于 2D-CD4(4.46 μM)。进一步构建的 CD4-Ig 和 CD4-IgG2 融合蛋白(含抗体 Fc 区域)活性显著提升,IC??分别达 1.14 μM 和 1.31 μM,且对本迪布焦埃博拉病毒(BDBV)也有抑制作用。在 BSL-4 实验室中,4D-CD4 对真实 EBOV 的 IC??为 1.07 μM,验证了其抗病毒效力。

CD4 模拟小分子(CD4mcs)的抑制作用


经典 CD4mc 化合物 NBD-556 和 NBD-557 对 EBOV 的 IC??分别为 18.21 μM 和 19.76 μM。通过结构优化,设计合成了仅修饰区域 I(取代苯环)的衍生物(如 DY-III-228),其 IC??低至 1.98 μM,表明区域 I 是结合关键位点,而区域 III(四甲基哌啶)的空间结构会显著影响活性。

作用机制与靶点特异性验证


生物层干涉实验显示,sCD4 与 EBOV GP 受体结合域(RBD)的结合亲和力在酸性条件(pH 6.1,KD=0.36 μM)下显著高于中性条件(pH 7.4,KD=52 μM),与内体环境一致。竞争结合实验证实,sCD4 和 CD4mcs 可与 NPC1 竞争性结合 GP-RBD,当 sCD4 浓度为 20 μM 时,NPC1 结合率从 76.36% 降至 20.08%。靶向突变 GP-RBD 的保守位点(W83A/F86A)后,NPC1 结合率从野生型的 94.67% 骤降至 48.97%,进一步确认了 NPC1 结合位点(NPC1bs)为作用靶点。分子对接显示,sCD4 通过氢键和盐桥与 GP-RBD 结合,CD4mcs 的苯环插入 NPC1bs 的疏水腔,模拟 CD4 的结合模式。

研究结论与意义


本研究揭示了 HIV 受体 CD4 及其模拟物对 EBOV 的抑制作用,首次证明两种远缘病毒(HIV 与 EBOV)在受体结合位点存在结构相似性 —— 均通过疏水腔容纳苯环结构的氨基酸残基(如 HIV gp120 的 CD4 结合位点容纳 CD4 的 Phe-43,EBOV GP 的 NPC1bs 容纳 NPC1 的 Phe503)。这一发现不仅拓展了对病毒入侵机制的认知,更开辟了抗 EBOV 药物研发的新方向:以 NPC1bs 为靶点,利用 CD4mcs 的小分子特性开发高效抑制剂。鉴于马尔堡病毒等其他丝状病毒也依赖 NPC1 入侵,该研究为广谱抗丝状病毒药物提供了理论基础与候选分子,具有重要的临床转化价值和公共卫生意义。

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