综述：Var基因、菌株超多样性及疟疾传播动力学

（编辑推荐）该综述创新性地将群体遗传学（Population genetics）与数学模型结合，聚焦恶性疟原虫（Plasmodium falciparum）表面抗原PfEMP1的编码基因var家族，揭示其高频重组特性如何通过免疫选择塑造疟疾传播动态，为病原体监测提供新范式。

　　

Highlights

当前疟疾建模与恶性疟原虫（P. falciparum）群体遗传学研究仍存在明显分野。随着var基因深度测序技术的突破，研究者开始解析这一编码红细胞期关键表面抗原PfEMP1的多基因家族——其成员通过高频重组产生超乎想象的多样性，形成"菌株超多样性"现象。这种复杂性正是疟原虫逃避宿主免疫的核心策略，也为建立新型监测体系提供了分子靶标。

Abstract

病原体监测的微生物学范式要求追踪免疫选择压力下主要表面抗原的变异规律。恶性疟原虫的var基因家族完美诠释了这一理论：60个成员通过染色体内部重组不断生成新变异体，使PfEMP1蛋白持续刷新免疫识别表位。这种"抗原逃逸"直接驱动疟疾传播动态，促使研究者将群体遗传学分析与数理模型结合。例如，通过量化var基因重组率与人群免疫压力相关性，可预测特定变异体在流行病学中的扩散轨迹。

（专业细节）var基因的镶嵌式重组机制涉及启动子交换、外显子洗牌等事件，其变异速率比传统突变高3个数量级。最新研究发现，高传播区患者体内平均携带15种var单倍型，而低传播区仅2-3种，印证了传播强度与基因多样性的正反馈循环。这种动态平衡为理解疟疾地方性流行提供了种群遗传学框架，也为疫苗设计中的多价抗原选择提供了理论依据。