DGE-AUC 无模型依赖法测定浮力密度的基础研究

【字体: 时间:2025年05月21日 来源:Analytical Biochemistry 2.6

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  当前密度梯度平衡分析超速离心(DGE-AUC)的模型依赖法难考量压力效应等复杂因素,需参考材料。研究人员开发新型无模型依赖法测定颗粒浮力密度,在 CsCl 和蔗糖梯度中验证,该法普适且无需标准物,为相关领域提供新工具。

  
在生物大分子与纳米颗粒的分析领域,准确测定颗粒的浮力密度是理解其物理性质与功能的关键。传统的密度梯度平衡分析超速离心(DGE-AUC)方法多依赖模型计算,但梯度介质的压力效应、溶剂可压缩性及非理想行为等复杂因素难以被现有模型完全描述,导致实验中常需引入参考物质(如大肠杆菌 DNA、噬菌体 DNA)或标准条件,这不仅增加了操作复杂性,也限制了方法对复杂体系(如异质颗粒、多组分病毒样颗粒)的适用性。随着细胞与基因治疗等新兴医学领域的发展,迫切需要一种无需标准物、能适应多样化颗粒组成的通用浮力密度测定方法。

为此,来自相关研究机构的研究人员开展了一项关于 DGE-AUC 无模型依赖法测定颗粒浮力密度的研究。该研究成果发表在《Analytical Biochemistry》,为生物分析领域提供了一种更普适、准确的分析工具。

研究主要采用密度梯度平衡分析超速离心(DGE-AUC)技术,结合现代干涉光学系统(用于测量离心池中两通道的折射率差异),对不同体系进行分析。实验选用了 NIST 单克隆抗体标准物质(NISTmAb;RM 8671)、λ DNA、聚苯乙烯(PS)珠作为模型颗粒,分别在氯化铯(CsCl)梯度和蔗糖梯度中进行离心实验,通过全局分析数据实现浮力密度的无模型依赖测定。

材料与方法关键要点


研究使用了 NIST 提供的单克隆抗体(NISTmAb)、NEB 的 λ DNA,以及 Sigma-Aldrich 的苯乙烯、丙烯酸等试剂。通过制备不同浓度的 CsCl 和蔗糖梯度,将颗粒样品加入后进行离心,利用 Beckman Optima XL-I 系列离心机的干涉检测系统收集数据,分析颗粒在梯度中的平衡位置与密度分布关系。

实验结果分析


  1. NISTmAb 在 CsCl 溶液中的行为
    通过在低浓度和高浓度 CsCl 溶液中离心 NISTmAb,观察到颗粒分别呈现沉降(类似传统沉降速度分析超速离心,SV-AUC)和上浮行为。当 CsCl 浓度适中时,NISTmAb 在密度梯度中达到平衡,其位置对应自身的浮力密度。这一现象直观展示了 DGE-AUC 通过调节梯度介质浓度使颗粒达到浮力平衡的原理。

  2. λ DNA 在 CsCl 梯度中的验证
    实验验证了 λ DNA 在 CsCl 梯度中的浮力密度与 GC 含量的相关性,与早期基于模型依赖法的研究结果一致,但无需引入参考 DNA 标准物。通过干涉数据的全局分析,直接计算出 λ DNA 的浮力密度,证明了无模型依赖法的准确性。

  3. 聚苯乙烯珠在蔗糖梯度中的应用
    针对不吸收紫外光的聚苯乙烯珠,利用干涉检测系统单独完成分析,结果显示其浮力密度与理论值吻合。这表明该方法适用于无紫外吸收的颗粒,扩展了 DGE-AUC 的应用范围。


结论与讨论


本研究建立了一种基于 DGE-AUC 的无模型依赖法,可直接通过全局数据分析测定颗粒的浮力密度,无需依赖参考物质或预设模型,避免了传统方法中因忽略梯度介质非理想行为导致的误差。实验在 CsCl 和蔗糖两种梯度体系中,对蛋白质(NISTmAb)、核酸(λ DNA)、合成颗粒(聚苯乙烯珠)均实现了准确测定,证明了方法的普适性与可靠性。

该方法的重要意义在于:

  1. 简化操作:无需引入标准参考物,降低了实验成本与操作复杂度;
  2. 适应复杂体系:可分析异质颗粒(如不同装载状态的腺相关病毒 AAV)、多组分颗粒(如蛋白质 - DNA 复合物),满足新兴治疗领域(如基因治疗、病毒载体生产)对复杂样品表征的需求;
  3. 提升准确性:通过全局分析与误差估计,避免了模型假设带来的局限性,尤其适用于溶剂可压缩性或压力效应显著的梯度体系。

该研究为生物大分子、纳米颗粒及病毒载体的物理化学表征提供了新的技术范式,有望在生物制药质量控制、基因治疗药物开发等领域发挥重要作用,推动分析超速离心技术在生命科学与健康医学中的进一步应用。

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