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本文聚焦国际空间站(ISS)分离的新种麦卡瑟微杆菌(Microbacterium mcarthurae),揭示其通过多组学分析确认为新种,在 ISS 广泛定殖且丰度随时间增加,具多重抗生素耐药性及增强毒力,强调太空微生物监测与防控的重要性。
新种微生物的分离与分类鉴定
从国际空间站(ISS)乘员舱壁分离到一株编号为 1F8SW-P5T的细菌,其为革兰氏阳性、严格需氧、无芽孢形成的化能异养中温杆菌,具过氧化氢酶阳性、氧化酶阴性反应。通过 16S rRNA 基因(与Microbacterium proteolyticum CECT 8356T相似度 99.34%)、gyrB 基因(与Microbacterium algihabitans KSW2-21T相似度 91.34%)分析及平均核苷酸一致性(ANI,84.36%)、DNA-DNA 杂交(dDDH,25.80%)等,确认其为微杆菌属新种,命名为Microbacterium mcarthurae,模式菌株为 1F8SW-P5T(=DSM 115934T=NRRL B-65667T)。
系统发育与比较基因组分析
全基因组组装显示菌株基因组大小为 3,201,193 bp,G+C 含量 69.9%。系统发育树显示其与M. hydrothermale等构成独立分支,16S rRNA 基因树与全基因组树存在差异,gyrB 基因树支持全基因组结果。功能富集分析发现其含 D - 乳酸脱氢酶(乙醛脱氢酶 III)、芽孢衣蛋白 CotH 和多药耐药外排泵 EmrA 等基因,推测与太空寡营养环境适应相关。
表型与化学分类特征
菌株在 TSA 培养基上形成黄色菌落,生长温度 4–40°C(最适 35°C),盐浓度 0.5%–15%(最适 4%–5%),pH 6.0–9.0。主要脂肪酸为 15:0 anteiso、16:0 iso、16:0 和 17:0 anteiso;极性脂质包括二磷脂酰甘油(DPG)、磷脂酰甘油(PG)和未知糖脂(GL);呼吸醌为 MK-10、MK-11 和 MK-12;肽聚糖类型为 B2β,细胞壁含鸟氨酸、半乳糖、葡萄糖等。
太空分布的时空动态
宏基因组数据显示,M. mcarthurae在 8 年期间的 3 次微生物追踪任务中,从所有 8 个表面均被检测到,MT-3 任务中相对丰度显著增加,在穹顶舱等表面富集,表明其在 ISS 广泛定殖且丰度随时间上升,分布无明显生境选择性。
质粒特征与耐药毒力表型
质粒长度 42,806 bp,G+C 含量 65.58%,含铜和铬抗性基因,与其他微杆菌属菌株质粒部分同源。基因型分析未发现抗生素耐药(AMR)和毒力相关基因,但表型实验显示其对所有测试氟喹诺酮类、2 种 β- 内酰胺类(氨曲南、苯唑西林)和 1 种大环内酯类抗生素耐药,存在 9 例假阴性结果。秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)模型显示其毒力高于大肠杆菌(Escherichia coli),但低于铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa),表现为中等杀伤能力。
讨论与意义
M. mcarthurae的发现揭示了 ISS 微生物组中潜在病原体的适应性进化,其耐药性与毒力表型未被基因型预测,提示需加强未知耐药基因监测。太空环境压力可能促进水平基因转移,增加感染风险。本研究为航天器微生物防控策略制定提供了重要依据,强调持续表征太空相关微生物的必要性。