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非幽门螺杆菌(NHPH)与人和动物健康相关,其中 suis、heilmannii、ailurogastricus 是感染人类胃部并致消化性溃疡、胃炎等疾病的主要菌种。研究首次报道这 3 种菌模式菌株的完整基因组序列,为分析其毒力提供数据支撑。
非幽门螺杆菌(Non-Helicobacter pylori Helicobacter, NHPH)类群定殖于人和动物胃部并与健康相关。本研究聚焦感染人类胃部的主要 NHPH 菌种 —— 猪幽门螺杆菌(Helicobacter suis)、海尔曼螺杆菌(Helicobacter heilmannii)和猫胃螺杆菌(Helicobacter ailurogastricus),首次完成其模式菌株全基因组测序。
菌株 HS1T(H. suis)、ASB1T(H. heilmannii)、ASB7T(H. ailurogastricus)分别分离自猪、猫,采用 Illumina MiniSeq 和 Oxford Nanopore MinION 进行测序,经组装校正获得完整基因组。结果显示,三者基因组大小分别为 1,689,191 bp、1,660,951 bp、1,609,065 bp,含 1-3 个质粒,GC 含量 40.1%-47.6%,编码 1,699-1,925 个蛋白编码序列(CDS),基因组完整性超 98%。
该研究为解析 NHPH 菌种及菌株毒力机制提供关键遗传资源,助力相关胃部疾病(如消化性溃疡、慢性胃炎、胃癌等)的致病机制研究与防控策略开发。