尼日利亚土壤源Acinetobacter junii ABJ_A23_1菌株基因组草图揭示其生态适应性与潜在临床意义

来自尼日利亚的研究团队报道了从Gwagwalada土壤中分离的Acinetobacter junii ABJ_A23_1菌株基因组草图。该研究通过Illumina MiSeq测序和SPAdes组装获得3.2 Mb基因组（GC含量38.48%），鉴定出2,975个蛋白编码基因及1个143 kb接合元件(ICE)，并通过ANI分析（97.42%）确认其分类地位。值得注意的是，CARD数据库预测到介导消毒剂抗性的qacG外排泵基因，为理解该环境菌株的耐药性进化提供了新线索。

　　

在尼日利亚Gwagwalada地区（坐标8°58′51″N, 7°03′04″E）的溪流沉积物中，科学家们捕获了一株颇具研究价值的细菌——Acinetobacter junii ABJ_A23_1。通过矿物盐培养基预富集和CHROMagar显色培养，这些革兰氏阴性菌展现出典型的猩红色菌落特征。

借助Illumina MiSeq平台产生的1,300万条双端测序数据，研究团队采用SPAdes算法成功拼装出包含126个contigs的基因组草图（N₅₀ 62,941 bp）。这个3.2兆碱基的基因组藏着不少秘密：38.48%的GC含量、2,975个蛋白编码基因，还有64个tRNA守卫着蛋白质合成工厂。通过平均核苷酸一致性(ANI)分析，该菌株与模式菌株NCTC10307^T的相似度高达97.42%，稳稳坐实了其A. junii的物种身份。

有趣的是，虽然常规耐药基因检测工具ResFinder未能发现β-内酰胺酶(bla_OXA)等经典抗性基因，但CARD数据库却揪出了一个"微型武器库"——编码消毒剂抗性的qacG外排泵基因。更令人振奋的是，基因组2.23-2.37 Mb区间藏着一个143 kb的"基因快递员"（整合接合元件ICE），配备完整的IV型分泌系统，暗示着该环境菌株可能具备水平基因转移的潜力。

这项研究不仅扩充了Acinetobacter junii的基因组数据库，其发现的ICE元件和特殊抗性机制，为理解这类"一健康"(One Health)病原体从环境向临床传播的进化路径提供了分子线索。