孟加拉国市售鸡肉香肠中单核细胞增生李斯特菌AZLM01株基因组草图解析及其临床意义

来自孟加拉国的研究人员针对高致死性食源性病原体单核细胞增生李斯特菌（L. monocytogenes），对市售即食鸡肉香肠分离株AZLM01进行全基因组测序。研究采用Illumina NextSeq 2000平台完成2.9Mb基因组草图，鉴定出31个毒力基因及独特酪氨酸重组酶XerC基因，为东南亚地区食源性疾病防控提供重要分子流行病学数据。

　　

这份研究报告揭示了从孟加拉国达卡市售鸡肉香肠中分离的单核细胞增生李斯特菌（Listeria monocytogenes）AZLM01菌株的基因组特征。作为革兰氏阳性兼性厌氧菌，该病原体携带37.9%的低GC含量基因组，通过牛津琼脂平板筛选和^lmo2234基因PCR验证获得纯培养。

研究团队采用Illumina NextSeq 2000平台完成150bp双端测序，经Trimmomatic质控和Unicycler组装获得18条contigs（N₅₀=386,951bp）。基因组注释发现2893个编码序列，并检测到3段噬菌体序列（最长38.8kb）。值得注意的是，该菌株携带林可酰胺和磷霉素耐药基因，且通过Roary泛基因组分析鉴定出2个特有基因——酪氨酸重组酶XerC和ATP依赖性ClpP蛋白酶亚基编码基因。

功能注释显示31个毒力相关基因的存在，包括引发脑膜炎、心内膜炎等严重感染的关键因子。该研究为理解东南亚地区食源性李斯特菌的分子进化提供了首个基因组框架，特别揭示了即食肉制品中菌株特有的遗传标记。项目由孟加拉独立大学科研基金资助，所有实验数据均遵循制造商标准流程完成。